More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_31550 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_31550  transcriptional regulator  100 
 
 
191 aa  384  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03760  transcriptional regulator, TetR family  45.41 
 
 
201 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.599281  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  44.15 
 
 
198 aa  132  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.792237 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4955  transcriptional regulator, TetR family  44.75 
 
 
218 aa  132  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00123858  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 
197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0051  transcriptional regulator, TetR family  43.98 
 
 
192 aa  122  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0191549  normal  0.55733 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  42.51 
 
 
191 aa  121  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  38.59 
 
 
192 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 
200 aa  114  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
201 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 
201 aa  111  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
188 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  36.93 
 
 
188 aa  111  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 
189 aa  111  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  40.49 
 
 
221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
201 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 
221 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
189 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  39.55 
 
 
204 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 
204 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
204 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
215 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  39.26 
 
 
210 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  38.31 
 
 
189 aa  102  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 
189 aa  102  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  35.86 
 
 
208 aa  101  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  37.85 
 
 
205 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 
202 aa  99.8  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2807  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
214 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1735  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
214 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3169  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
214 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0031  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
214 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0430  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 
207 aa  98.6  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 
207 aa  98.2  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
205 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
205 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
205 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 
206 aa  97.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
205 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
205 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
205 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
205 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3628  TetR family transcriptional regulator  37.91 
 
 
214 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
207 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  37.91 
 
 
214 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 
183 aa  96.3  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 
222 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  40.76 
 
 
179 aa  96.3  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3614  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 
218 aa  96.3  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1089  TetR family transcriptional regulator  37.91 
 
 
212 aa  95.9  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
201 aa  95.5  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
190 aa  95.5  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
197 aa  95.5  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2898  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 
206 aa  95.1  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.881728  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 
201 aa  94.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
206 aa  94.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
206 aa  94.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 
201 aa  94.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
210 aa  94  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
206 aa  93.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 
187 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 
201 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  34.64 
 
 
185 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3569  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 
217 aa  91.3  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 
211 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
228 aa  90.5  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
257 aa  90.5  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
196 aa  90.9  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 
190 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
192 aa  90.1  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 
181 aa  89  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0135  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 
181 aa  89  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
216 aa  88.2  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 
189 aa  88.2  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  30.56 
 
 
193 aa  87.4  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5255  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 
196 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5344  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 
196 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772275  normal  0.605205 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5634  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 
196 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3878  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 
200 aa  86.7  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0990278  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0101  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
204 aa  87  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
211 aa  86.7  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  38.26 
 
 
191 aa  87  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3360  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
197 aa  85.5  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 
188 aa  85.5  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 
202 aa  84  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0306  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
186 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.278171  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2930  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 
193 aa  83.6  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 
200 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8687  transcriptional regulator, TetR family  35.22 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0127  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 
191 aa  82  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00410003  normal  0.28897 
 
 
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NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
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NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  35 
 
 
185 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
197 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 
187 aa  81.3  0.000000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 
202 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
203 aa  80.9  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.520137 
 
 
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NC_013132  Cpin_2697  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 
202 aa  80.5  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
191 aa  80.5  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
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NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
202 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
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