More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3230 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 191 aa  391  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  58.42 
 
 		 197 aa  198  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4955  transcriptional regulator, TetR family  48.62 
 
 		 218 aa  161  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00123858  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03760  transcriptional regulator, TetR family  46.35 
 
 		 201 aa  149  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.599281  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0051  transcriptional regulator, TetR family  46.41 
 
 		 192 aa  138  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0191549  normal  0.55733 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31550  transcriptional regulator  41.08 
 
 		 191 aa  128  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  40.54 
 
 		 198 aa  127  8.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.792237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 200 aa  117  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 190 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 194 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8687  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1449  transcriptional regulator, TetR family  37.91 
 
 		 203 aa  108  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126985  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  39.26 
 
 		 189 aa  108  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  39.55 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 208 aa  105  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  37.99 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 192 aa  104  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 189 aa  104  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 189 aa  104  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 189 aa  104  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1089  TetR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  37.99 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5689  transcriptional regulator, TetR family  40.65 
 
 		 219 aa  101  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.784661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3995  regulatory protein, TetR  36.79 
 
 		 225 aa  101  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0135  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 181 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 204 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 210 aa  99  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5634  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 196 aa  98.2  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5255  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 196 aa  98.2  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5344  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 196 aa  98.2  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772275  normal  0.605205 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2930  transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 		 193 aa  95.9  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2890  TetR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 202 aa  95.1  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 205 aa  94.4  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 197 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2965  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 175 aa  94  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1385  transcriptional regulator, TetR family  36.18 
 
 		 178 aa  94  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0127  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 191 aa  93.2  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00410003  normal  0.28897 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2898  TetR family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.881728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 211 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 204 aa  92.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  92.4  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 215 aa  91.7  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 196 aa  91.7  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 205 aa  91.3  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 205 aa  91.3  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 205 aa  91.3  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 205 aa  91.3  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 205 aa  91.3  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 205 aa  91.3  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 205 aa  91.3  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3569  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 217 aa  90.1  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 191 aa  89.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 206 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3360  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 197 aa  89.7  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 206 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0430  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 207 aa  89.4  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 206 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 197 aa  88.6  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4372  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 187 aa  89  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 207 aa  89  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4828  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 207 aa  88.6  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 228 aa  88.2  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 216 aa  88.2  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 206 aa  88.2  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 190 aa  88.2  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 202 aa  88.2  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 194 aa  88.2  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2807  TetR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 214 aa  87.8  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3169  TetR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 214 aa  87.8  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1735  TetR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 214 aa  87.8  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0031  TetR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 214 aa  87.8  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1393  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 205 aa  87.8  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3614  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 218 aa  87.8  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 187 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 214 aa  87.8  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3628  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 214 aa  87.8  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8504  putative transcriptional regulator, TetR family  36.79 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2832  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1896  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.589186 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2299  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.633617  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3232  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 186 aa  86.3  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 202 aa  85.9  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 202 aa  85.1  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 183 aa  84.7  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 257 aa  84.3  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>