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for query gene Gobs_4828 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4828  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
207 aa  407  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  39.67 
 
 
215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  36.5 
 
 
222 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  40.49 
 
 
203 aa  123  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2898  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.881728  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  36.6 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3614  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
218 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3169  TetR family transcriptional regulator  38.59 
 
 
214 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2807  TetR family transcriptional regulator  38.59 
 
 
214 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1735  TetR family transcriptional regulator  38.59 
 
 
214 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0031  TetR family transcriptional regulator  38.59 
 
 
214 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3628  TetR family transcriptional regulator  38.59 
 
 
214 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  38.59 
 
 
214 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0430  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 
207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0306  transcriptional regulator, TetR family  39.52 
 
 
186 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.278171  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  36.68 
 
 
216 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03014  putative transcription regulator protein  38.79 
 
 
216 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3853  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 
213 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.26442  normal  0.765649 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3967  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 
213 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0630357 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  34.66 
 
 
207 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 
211 aa  101  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
200 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  33.52 
 
 
185 aa  99  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2299  TetR family transcriptional regulator  37.77 
 
 
201 aa  97.8  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.633617  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5286  TetR family transcriptional regulator  36.53 
 
 
196 aa  96.7  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1089  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
212 aa  96.3  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  34.08 
 
 
185 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  37.99 
 
 
189 aa  92.4  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 
181 aa  89.7  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 
206 aa  89  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
188 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
192 aa  88.6  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3569  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 
217 aa  88.2  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 
190 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
211 aa  85.5  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 
186 aa  84.7  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3995  regulatory protein, TetR  33.9 
 
 
225 aa  84  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 
191 aa  84.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 
189 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 
194 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4372  transcriptional regulator, TetR family  39.69 
 
 
187 aa  82  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 
188 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0101  TetR family transcriptional regulator  34.42 
 
 
204 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 
188 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 
201 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 
188 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
196 aa  77.4  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 
201 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 
188 aa  77  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 
189 aa  76.3  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6735  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1572  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6259  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6550  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 
200 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124296  normal  0.0144339 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  30.87 
 
 
257 aa  75.9  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8687  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1393  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2697  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 
202 aa  75.1  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
208 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
202 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
195 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
190 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
202 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0324  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2930  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 
193 aa  72  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  25.28 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31550  transcriptional regulator  29.79 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
191 aa  70.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2890  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  30.87 
 
 
183 aa  70.1  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3232  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
202 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  31.82 
 
 
198 aa  69.3  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.792237 
 
 
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NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 
194 aa  69.3  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal 
 
 
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NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_4188  hypothetical protein  31.68 
 
 
169 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
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NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  26.49 
 
 
193 aa  67.8  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
228 aa  67.8  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.620771 
 
 
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NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
202 aa  67.4  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.270822 
 
 
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NC_009485  BBta_5133  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 
195 aa  67.4  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0406235 
 
 
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NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 
202 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
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