More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5953 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  99.49 
 
 		 195 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 191 aa  250  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  64.25 
 
 		 188 aa  238  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  64.25 
 
 		 188 aa  238  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 200 aa  148  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
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NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 196 aa  145  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  39.78 
 
 		 189 aa  137  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  48.85 
 
 		 203 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  48.85 
 
 		 202 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  42.39 
 
 		 187 aa  131  6e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  39.11 
 
 		 189 aa  124  7e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 197 aa  124  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1333  transcriptional regulator, TetR family  45.88 
 
 		 196 aa  123  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 192 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  37.85 
 
 		 189 aa  123  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
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NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  41.29 
 
 		 190 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 207 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 203 aa  117  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  45.51 
 
 		 185 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 189 aa  117  9e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 179 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 257 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  45.52 
 
 		 204 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  45.52 
 
 		 204 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 191 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 200 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 201 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  40.8 
 
 		 201 aa  111  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  43.59 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  40.23 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  45.38 
 
 		 221 aa  108  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  45.04 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
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NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 186 aa  106  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  39.38 
 
 		 204 aa  105  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 222 aa  104  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2965  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 204 aa  99.4  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 192 aa  99.4  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34730  transcriptional regulator, TetR family  35.46 
 
 		 192 aa  98.6  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3232  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 204 aa  98.2  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 202 aa  98.2  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3360  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 197 aa  96.7  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0474  transcriptional regulator, TetR family  36.18 
 
 		 234 aa  95.5  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 210 aa  95.5  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0803  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 174 aa  95.1  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 		 183 aa  95.1  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1896  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 196 aa  94.4  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.589186 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 		 188 aa  94.4  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1393  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 205 aa  93.6  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 190 aa  93.2  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 211 aa  92  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 206 aa  92  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 202 aa  92  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 206 aa  91.7  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 206 aa  91.7  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 181 aa  90.9  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 202 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0101  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 204 aa  90.5  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0430  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2697  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 202 aa  90.5  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2890  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 202 aa  89.7  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 179 aa  89.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_2832  transcriptional regulator, TetR family  44.76 
 
 		 210 aa  89  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_014158  Tpau_2930  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 193 aa  89  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_0127  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 191 aa  89  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00410003  normal  0.28897 
 
 
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NC_003910  CPS_2510  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 181 aa  88.6  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.225069  n/a   
 
 
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NC_008789  Hhal_0394  TetR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 186 aa  87.4  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509635  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 215 aa  87.4  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 216 aa  87.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010084  Bmul_2898  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.881728  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 189 aa  86.3  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_1089  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009080  BMA10247_3169  TetR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 214 aa  85.9  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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