More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3587 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  422  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  94.66 
 
 		 206 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  94.66 
 
 		 206 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  93.69 
 
 		 206 aa  400  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2898  TetR family transcriptional regulator  89.81 
 
 		 206 aa  381  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.881728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  90.34 
 
 		 207 aa  380  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0430  TetR family transcriptional regulator  90.82 
 
 		 207 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  73.47 
 
 		 215 aa  295  4e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3628  TetR family transcriptional regulator  77.78 
 
 		 214 aa  294  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  77.78 
 
 		 214 aa  294  7e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2807  TetR family transcriptional regulator  77.25 
 
 		 214 aa  291  6e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0031  TetR family transcriptional regulator  77.25 
 
 		 214 aa  291  6e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3169  TetR family transcriptional regulator  77.25 
 
 		 214 aa  291  6e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1735  TetR family transcriptional regulator  77.25 
 
 		 214 aa  291  6e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3614  TetR family transcriptional regulator  76.72 
 
 		 218 aa  290  9e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  62.62 
 
 		 222 aa  260  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  63.05 
 
 		 211 aa  244  6e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  62.07 
 
 		 216 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03014  putative transcription regulator protein  57 
 
 		 216 aa  201  7e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3967  transcriptional regulator, TetR family  60.11 
 
 		 213 aa  195  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0630357 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3853  transcriptional regulator, TetR family  60.11 
 
 		 213 aa  195  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.26442  normal  0.765649 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2299  TetR family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 201 aa  158  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.633617  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0306  transcriptional regulator, TetR family  45.12 
 
 		 186 aa  147  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.278171  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  42.26 
 
 		 197 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 197 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1089  TetR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4828  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  39.87 
 
 		 179 aa  108  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 187 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1449  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 203 aa  106  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126985  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  38.99 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 188 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6699  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 207 aa  101  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.678516  normal  0.427356 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 201 aa  101  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 192 aa  101  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 183 aa  101  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3569  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 217 aa  101  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5286  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5796  transcriptional regulator, TetR family  37.58 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0048122 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3360  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 197 aa  99.4  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 189 aa  99.4  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 197 aa  98.2  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1896  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 196 aa  98.2  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.589186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 191 aa  97.8  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 194 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31550  transcriptional regulator  34.97 
 
 		 191 aa  97.4  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 206 aa  97.1  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 196 aa  94.7  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 202 aa  94  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 211 aa  94  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 187 aa  94.4  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 205 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 205 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 205 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 205 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 208 aa  93.2  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 205 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 205 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 201 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 205 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 195 aa  92.8  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 201 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 257 aa  93.2  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 192 aa  92.4  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 195 aa  92  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  36.18 
 
 		 185 aa  92  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 204 aa  92  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2890  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 202 aa  92  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1985  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 206 aa  92  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 204 aa  92  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 210 aa  91.7  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 201 aa  91.7  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 189 aa  91.7  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 194 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 228 aa  91.7  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 200 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1790  TetR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 209 aa  89.7  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 191 aa  89.4  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  34.15 
 
 		 185 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0051  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 192 aa  89  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0191549  normal  0.55733 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8687  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 176 aa  88.2  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 221 aa  88.2  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2697  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 202 aa  87.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  33.99 
 
 		 191 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03760  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.599281  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 189 aa  87.8  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 189 aa  86.7  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 202 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>