More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4162 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 210 aa  417  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  75.36 
 
 		 221 aa  295  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  79.7 
 
 		 221 aa  295  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  74.73 
 
 		 208 aa  277  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  75 
 
 		 205 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  75.65 
 
 		 205 aa  268  5e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  75.65 
 
 		 205 aa  268  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  75.65 
 
 		 205 aa  268  5e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  75.65 
 
 		 205 aa  268  5e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  75.65 
 
 		 205 aa  268  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  75.65 
 
 		 205 aa  268  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
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NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  75.65 
 
 		 205 aa  268  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  71 
 
 		 204 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  71 
 
 		 204 aa  263  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  71.5 
 
 		 201 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  71.5 
 
 		 201 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  71.5 
 
 		 201 aa  260  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  70.5 
 
 		 201 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  45.88 
 
 		 189 aa  177  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  52.76 
 
 		 197 aa  175  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 188 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 189 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 189 aa  171  6.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  45.55 
 
 		 194 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 188 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
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NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 189 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal  1 
 
 
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NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 200 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
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NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  42.56 
 
 		 192 aa  152  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
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NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  45.99 
 
 		 179 aa  136  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
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NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  39.89 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  39.36 
 
 		 201 aa  127  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  40.11 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
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NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  37.3 
 
 		 190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_2832  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 		 188 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal  1 
 
 
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NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
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NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  40.32 
 
 		 185 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  41.08 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.620771 
 
 
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NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 196 aa  116  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
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NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal  1 
 
 
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NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 195 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  41.24 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
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NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
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NC_009668  Oant_3360  TetR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  38.42 
 
 		 185 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_0193  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 184 aa  109  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  42.5 
 
 		 183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
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NC_013159  Svir_31550  transcriptional regulator  37.3 
 
 		 191 aa  108  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 202 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  44.72 
 
 		 194 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004347  SO_1393  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 205 aa  105  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 191 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  32.51 
 
 		 194 aa  105  7e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_34730  transcriptional regulator, TetR family  39.23 
 
 		 192 aa  105  7e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  1 
 
 
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NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 187 aa  104  8e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_1896  transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 		 196 aa  104  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.589186 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 202 aa  104  9e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 192 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3995  regulatory protein, TetR  34.41 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0101  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 204 aa  102  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3232  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 204 aa  101  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012791  Vapar_1333  transcriptional regulator, TetR family  42.45 
 
 		 196 aa  101  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0127  transcriptional regulator, TetR family  39.46 
 
 		 191 aa  101  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00410003  normal  0.28897 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 202 aa  101  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 203 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
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NC_009953  Sare_2890  TetR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 202 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011886  Achl_0474  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 234 aa  99.8  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 202 aa  98.2  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 204 aa  98.2  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 191 aa  97.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  41.35 
 
 		 191 aa  97.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  44.37 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.792237 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 190 aa  97.1  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
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NC_013530  Xcel_1385  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 178 aa  96.7  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  44.17 
 
 		 189 aa  95.9  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0135  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 181 aa  95.9  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 197 aa  95.9  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 203 aa  95.1  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 194 aa  95.1  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  40.46 
 
 		 188 aa  94  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  40.46 
 
 		 188 aa  94  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2930  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 193 aa  93.6  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5689  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.784661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
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NC_008836  BMA10229_A1735  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2807  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0031  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_3169  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
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NC_013457  VEA_001160  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 181 aa  89.4  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
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NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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