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for query gene PSPA7_2105 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 185 aa  367  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  92.39 
 
 		 185 aa  335  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 200 aa  137  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2816  TetR family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 192 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 196 aa  132  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  43.26 
 
 		 201 aa  127  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  43.26 
 
 		 201 aa  127  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 201 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  38.8 
 
 		 189 aa  122  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 189 aa  122  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  37.22 
 
 		 189 aa  121  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  44.13 
 
 		 207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 202 aa  119  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 202 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
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NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 183 aa  111  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
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NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  41.11 
 
 		 179 aa  111  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 204 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009997  Sbal195_3232  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 202 aa  108  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
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NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  37.77 
 
 		 194 aa  108  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1393  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 205 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  40.66 
 
 		 204 aa  107  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
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NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 222 aa  104  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 208 aa  104  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3701  transcriptional regulator of TetR family protein  35.71 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0193  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 188 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 188 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 192 aa  100  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 190 aa  100  9e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  49.04 
 
 		 196 aa  100  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  36.36 
 
 		 193 aa  100  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0394  TetR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 186 aa  99.8  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509635  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 187 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal  1 
 
 
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NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 194 aa  98.2  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2510  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 181 aa  97.1  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.225069  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4828  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 207 aa  96.3  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1449  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 203 aa  96.7  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126985  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 201 aa  96.3  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 201 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 189 aa  96.3  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 201 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 206 aa  96.3  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 210 aa  95.9  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 215 aa  95.9  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 204 aa  95.9  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 205 aa  95.1  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 205 aa  95.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 205 aa  95.1  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 205 aa  95.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 191 aa  95.5  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 201 aa  95.5  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 204 aa  95.5  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 202 aa  95.5  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 205 aa  95.1  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 205 aa  95.1  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 205 aa  95.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2697  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 202 aa  95.1  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 191 aa  95.1  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03760  transcriptional regulator, TetR family  35.91 
 
 		 201 aa  95.1  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.599281  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 210 aa  94.7  7e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1896  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 196 aa  94.4  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.589186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8504  putative transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 197 aa  93.6  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 257 aa  92.4  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5133  TetR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 195 aa  92.4  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 188 aa  92  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 206 aa  91.7  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8687  transcriptional regulator, TetR family  40.8 
 
 		 176 aa  91.3  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2930  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 193 aa  91.3  8e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 197 aa  90.9  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0368  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 184 aa  90.9  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00011837  normal  0.0425 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 206 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 206 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0430  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 203 aa  90.1  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 186 aa  90.1  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
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NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  37.08 
 
 		 198 aa  89.4  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.792237 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3169  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 214 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2807  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 214 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 206 aa  89.4  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 207 aa  89  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012856  Rpic12D_0324  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 192 aa  89.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A0031  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 214 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A1735  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 214 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 214 aa  89.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_3628  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 214 aa  89.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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