More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8504 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8504  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 197 aa  390  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 190 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 257 aa  108  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 188 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 189 aa  102  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  35.64 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  39.05 
 
 		 183 aa  98.6  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 201 aa  98.2  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 189 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 192 aa  96.3  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  35.11 
 
 		 185 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 201 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 201 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 205 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 197 aa  95.9  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 205 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 201 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 205 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 204 aa  95.9  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 205 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 205 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 205 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 205 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 204 aa  95.5  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 200 aa  94.7  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  39.88 
 
 		 197 aa  94.4  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  35.39 
 
 		 204 aa  94  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5255  TetR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 188 aa  93.6  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 201 aa  93.2  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03760  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.599281  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5344  TetR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772275  normal  0.605205 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5689  transcriptional regulator, TetR family  39.1 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.784661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5634  TetR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 196 aa  92.8  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 201 aa  92.4  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 190 aa  92.4  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 210 aa  92  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2890  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 202 aa  92  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 201 aa  91.7  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  41.72 
 
 		 191 aa  91.7  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 189 aa  91.3  9e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3995  regulatory protein, TetR  35.38 
 
 		 225 aa  89.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 203 aa  90.5  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 211 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 202 aa  89.7  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 188 aa  89.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0051  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 192 aa  89.7  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0191549  normal  0.55733 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 191 aa  89.4  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 188 aa  89.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 210 aa  89  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 216 aa  88.6  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13194  TetR/AcrR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 200 aa  88.2  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.338711 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0193  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 184 aa  87.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 181 aa  86.3  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 228 aa  85.5  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0135  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2299  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.633617  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2930  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3569  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0306  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.278171  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2510  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 181 aa  81.3  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.225069  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 202 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1679  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1089  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4188  hypothetical protein  37.27 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001160  transcriptional regulator  31.43 
 
 		 181 aa  78.2  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 197 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2807  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_3169  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A0031  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A1735  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_3628  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_34730  transcriptional regulator, TetR family  40.59 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  1 
 
 
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NC_010678  Rpic_3853  transcriptional regulator, TetR family  36.88 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.26442  normal  0.765649 
 
 
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NC_012857  Rpic12D_3967  transcriptional regulator, TetR family  36.88 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0630357 
 
 
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NC_003296  RS03014  putative transcription regulator protein  34.57 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.262128 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
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NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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