More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1679 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_1679  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
185 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000226335 
 
 
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NC_013457  VEA_001160  transcriptional regulator  56.02 
 
 
181 aa  201  6e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2510  TetR family transcriptional regulator  49.43 
 
 
181 aa  182  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.225069  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  48.91 
 
 
202 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  48.37 
 
 
202 aa  168  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 
202 aa  165  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3232  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
204 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
204 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1393  TetR family transcriptional regulator  42.16 
 
 
205 aa  145  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0193  TetR family transcriptional regulator  46.07 
 
 
184 aa  136  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  40.11 
 
 
181 aa  121  7e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 
194 aa  106  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
192 aa  99.8  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
202 aa  99  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
203 aa  99  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  31.89 
 
 
189 aa  97.8  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 
189 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  36.97 
 
 
179 aa  96.3  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 
189 aa  95.5  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
187 aa  94  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
194 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
188 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
188 aa  92  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  32.8 
 
 
198 aa  92  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.792237 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0135  transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 
181 aa  91.7  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 
189 aa  90.5  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 
196 aa  89.4  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
197 aa  89  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2816  TetR family transcriptional regulator  38.35 
 
 
192 aa  87.8  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 
204 aa  87.8  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  37.6 
 
 
204 aa  87.4  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  37.02 
 
 
200 aa  86.7  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
191 aa  85.9  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 
257 aa  85.9  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 
201 aa  85.1  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  35.61 
 
 
196 aa  84.7  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 
201 aa  85.1  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 
197 aa  84.3  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1572  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
200 aa  84.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6735  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
200 aa  84.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6259  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
200 aa  84.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  38.66 
 
 
190 aa  84  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 
201 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6550  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 
200 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124296  normal  0.0144339 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
228 aa  82.8  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34730  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 
192 aa  82  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  30.64 
 
 
193 aa  82  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
192 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
200 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  35.76 
 
 
207 aa  81.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  34.04 
 
 
185 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0324  transcriptional regulator, TetR family  37.19 
 
 
192 aa  81.3  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 
183 aa  80.5  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
195 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
195 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 
205 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 
205 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 
205 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 
205 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 
205 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 
205 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 
205 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0041  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
175 aa  78.2  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  34.39 
 
 
185 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 
179 aa  77  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 
191 aa  77  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6808  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
200 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03760  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.599281  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  39.45 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  39.45 
 
 
201 aa  74.7  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2832  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0803  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 
174 aa  74.3  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  31.54 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 
221 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5133  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
195 aa  73.2  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0474  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0101  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  38.53 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
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NC_009439  Pmen_0234  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013739  Cwoe_5689  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 
219 aa  72  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.784661  normal 
 
 
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NC_014210  Ndas_1896  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 
196 aa  71.6  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.589186 
 
 
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NC_008709  Ping_3701  transcriptional regulator of TetR family protein  31.03 
 
 
206 aa  72  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal 
 
 
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NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 
203 aa  71.2  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.520137 
 
 
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NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 
187 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal 
 
 
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NC_014158  Tpau_2930  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
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NC_009668  Oant_3360  TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007954  Sden_0550  regulatory protein, TetR  30.49 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009441  Fjoh_2965  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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