More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6259 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6735  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1572  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6259  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0324  transcriptional regulator, TetR family  63.24 
 
 		 192 aa  248  4e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6550  transcriptional regulator, TetR family  58.06 
 
 		 200 aa  226  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124296  normal  0.0144339 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6808  TetR family transcriptional regulator  60.21 
 
 		 200 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  39.75 
 
 		 193 aa  134  7.000000000000001e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3722  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 201 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 196 aa  102  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 200 aa  101  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 181 aa  99  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 201 aa  99  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 189 aa  97.4  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 202 aa  95.9  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  34.78 
 
 		 185 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3232  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 204 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 202 aa  93.2  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 202 aa  92.8  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 189 aa  92.4  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  35.48 
 
 		 185 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 207 aa  92.4  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 192 aa  91.3  8e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 189 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 194 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1679  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 185 aa  89.4  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0394  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 186 aa  89.4  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509635  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0550  regulatory protein, TetR  30.81 
 
 		 199 aa  88.6  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 188 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 196 aa  87.8  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0193  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 194 aa  85.9  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1393  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 205 aa  85.9  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 190 aa  85.5  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 210 aa  85.5  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5133  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 195 aa  85.5  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 189 aa  85.1  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 208 aa  84.7  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 186 aa  84.7  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 190 aa  84.7  8e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0135  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001160  transcriptional regulator  28.39 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0101  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3701  transcriptional regulator of TetR family protein  34.43 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5689  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.784661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0234  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2510  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.225069  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4828  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0041  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1089  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31550  transcriptional regulator  32.02 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 194 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2697  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34730  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
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NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
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NC_012791  Vapar_1333  transcriptional regulator, TetR family  33.74 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
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NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
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NC_011312  VSAL_I1527  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  26.28 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.718491  n/a   
 
 
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NC_007643  Rru_A2816  TetR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 187 aa  72  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013530  Xcel_1385  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_8687  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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