More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6808 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6808  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  410  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0324  transcriptional regulator, TetR family  79.69 
 
 		 192 aa  329  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6735  TetR family transcriptional regulator  60.21 
 
 		 200 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1572  TetR family transcriptional regulator  60.21 
 
 		 200 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6259  TetR family transcriptional regulator  60.21 
 
 		 200 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6550  transcriptional regulator, TetR family  54.89 
 
 		 200 aa  211  7e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124296  normal  0.0144339 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  38.42 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3722  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 189 aa  101  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 204 aa  99.4  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3232  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 204 aa  99.4  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 201 aa  97.8  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1393  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 205 aa  95.5  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0193  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 184 aa  95.1  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 181 aa  92.4  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 211 aa  91.3  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 202 aa  90.5  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 196 aa  89.4  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 202 aa  89.4  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0394  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 186 aa  89  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509635  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 202 aa  88.6  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 194 aa  87.8  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
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NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0550  regulatory protein, TetR  31.06 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  37.1 
 
 		 185 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1385  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 178 aa  86.7  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 190 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  37.63 
 
 		 185 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 202 aa  85.1  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 195 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 195 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0135  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5133  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 188 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009953  Sare_2890  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 186 aa  77.8  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_1679  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 185 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34730  transcriptional regulator, TetR family  34.45 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013457  VEA_001160  transcriptional regulator  30.15 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2697  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3406  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.122321  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0127  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00410003  normal  0.28897 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0101  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 204 aa  72  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2816  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 192 aa  72  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2965  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2832  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2510  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.225069  n/a   
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009439  Pmen_0234  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
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NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
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NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
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NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  38.68 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_8687  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
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