239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1385 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1385  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 178 aa  351  2.9999999999999997e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2890  TetR family transcriptional regulator  57.95 
 
 		 202 aa  189  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0127  transcriptional regulator, TetR family  61.71 
 
 		 191 aa  179  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00410003  normal  0.28897 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2930  transcriptional regulator, TetR family  54.07 
 
 		 193 aa  174  5e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3995  regulatory protein, TetR  53.71 
 
 		 225 aa  171  6.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34730  transcriptional regulator, TetR family  57.67 
 
 		 192 aa  166  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0135  transcriptional regulator, TetR family  52.94 
 
 		 181 aa  160  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 188 aa  156  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4188  hypothetical protein  54.04 
 
 		 169 aa  154  8e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5689  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 219 aa  134  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.784661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 194 aa  121  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 188 aa  120  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 		 189 aa  117  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 208 aa  112  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 200 aa  104  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 196 aa  104  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 189 aa  102  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 204 aa  100  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 202 aa  100  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 192 aa  97.1  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 201 aa  96.3  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 201 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 201 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13194  TetR/AcrR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 200 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.338711 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 205 aa  95.9  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 201 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 194 aa  94.7  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 191 aa  94  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0474  transcriptional regulator, TetR family  38.5 
 
 		 234 aa  93.6  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  38.95 
 
 		 198 aa  94  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.792237 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 		 221 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 221 aa  93.2  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3232  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 		 201 aa  92  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0324  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 192 aa  91.7  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 210 aa  91.7  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31550  transcriptional regulator  35.23 
 
 		 191 aa  91.7  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4955  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 218 aa  91.3  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00123858  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 		 201 aa  91.3  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 257 aa  90.9  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  36.78 
 
 		 185 aa  90.9  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1393  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 205 aa  90.5  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 202 aa  89  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  89  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 201 aa  88.6  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  36.21 
 
 		 185 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 197 aa  89  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 210 aa  87.8  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6808  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 200 aa  87.4  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1896  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 196 aa  87.4  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.589186 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5255  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 196 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5344  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 196 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772275  normal  0.605205 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5634  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 196 aa  85.5  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3722  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 189 aa  84.3  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0193  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 184 aa  84  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  35.47 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0051  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0191549  normal  0.55733 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 211 aa  80.9  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1449  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126985  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2965  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2832  transcriptional regulator, TetR family  37.9 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_0803  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008541  Arth_0101  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_4472  transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.590949  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  36.48 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_03760  transcriptional regulator, TetR family  36.75 
 
 		 201 aa  77.8  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.599281  normal  0.484799 
 
 
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NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 187 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal  1 
 
 
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NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  77.4  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
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NC_009077  Mjls_2440  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 190 aa  77.8  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_1089  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  27.65 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_2399  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
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