More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4472 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4472  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 205 aa  402  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.590949  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13194  TetR/AcrR family transcriptional regulator  40.11 
 
 		 200 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.338711 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 189 aa  84.7  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0127  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00410003  normal  0.28897 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 189 aa  81.3  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 190 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5255  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5344  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772275  normal  0.605205 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5634  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.405857 
 
 
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NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  34.27 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  34.27 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
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NC_013530  Xcel_1385  transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  36.2 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
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NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
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NC_011666  Msil_2832  transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 210 aa  67.8  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1449  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126985  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1896  transcriptional regulator, TetR family  35.6 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.589186 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3878  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0990278  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 183 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2898  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.881728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 201 aa  62  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3995  regulatory protein, TetR  34.44 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5689  transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.784661  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03014  putative transcription regulator protein  34.34 
 
 		 216 aa  61.2  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0135  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2510  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 181 aa  61.2  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.225069  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4372  transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0430  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.469108 
 
 
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NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  57.63 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
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NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
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NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_3685  putative transcriptional regulator  26.38 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_5133  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406235 
 
 
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NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_3832  putative transcriptional regulator  26.38 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A0732  putative transcriptional regulator  26.38 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00595683  decreased coverage  0.00650584 
 
 
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NC_014158  Tpau_2930  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.530719 
 
 
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NC_009485  BBta_1790  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_1985  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  54.69 
 
 		 326 aa  58.2  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
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NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_2299  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.633617  normal  0.029766 
 
 
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NC_009511  Swit_3569  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  1 
 
 
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