More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2237 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 214 aa  428  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  49.26 
 
 		 200 aa  171  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 199 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  44.68 
 
 		 202 aa  153  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 223 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 192 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 192 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 192 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 192 aa  131  7.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 194 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 194 aa  123  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  43.83 
 
 		 191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  39.35 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  39.55 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  35.07 
 
 		 248 aa  90.9  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  39.77 
 
 		 195 aa  91.3  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 212 aa  88.2  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 215 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  35.33 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  37.72 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 246 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  49.44 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  44.14 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1677  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.981661 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  48.54 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  36.82 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  37.4 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3202  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3987  regulatory protein TetR  56.94 
 
 		 71 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.934886  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  33.49 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  37.58 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  30.37 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 226 aa  74.7  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1438  transcriptional regulator, TetR family  37.13 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.716565  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 209 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 209 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  44.66 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  28.34 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  48.84 
 
 		 213 aa  72  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 200 aa  72  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  56.36 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0100  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0488762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  45.35 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  53.33 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2833  transcriptional regulator, TetR family  33.99 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.889648 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  57.63 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8148  putative transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  30.57 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 241 aa  65.1  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  36.88 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4506  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4593  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10871  normal  0.699268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4889  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0053  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 188 aa  64.7  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573004  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  32.3 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3667  transcriptional regulator, TetR family  36.28 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.427463 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2366  transcriptional regulator, TetR family  28.73 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000270806  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  38.4 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  56.9 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0998  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1016  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355321  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_1026  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 214 aa  62  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  55.07 
 
 		 222 aa  62  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 251 aa  61.6  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
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NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
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NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
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NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5921  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
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NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  51.52 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
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NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_3184  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.13539  normal  0.42811 
 
 
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