More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4372 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



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PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4372  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 187 aa  377  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  54.39 
 
 		 189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  46.33 
 
 		 192 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8687  transcriptional regulator, TetR family  42.6 
 
 		 176 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  39.52 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1449  transcriptional regulator, TetR family  42.01 
 
 		 203 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126985  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  39.52 
 
 		 197 aa  107  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  39.88 
 
 		 179 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 197 aa  99.4  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 197 aa  99.4  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  38.76 
 
 		 204 aa  97.8  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 191 aa  97.8  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 201 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 201 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 201 aa  95.9  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 203 aa  94.4  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 189 aa  94.4  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 222 aa  94  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 192 aa  93.6  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  32.92 
 
 		 186 aa  92.8  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 189 aa  92  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 202 aa  91.3  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 192 aa  90.5  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 215 aa  89.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 191 aa  90.1  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 201 aa  89.4  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3722  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 189 aa  89.4  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 191 aa  89  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 228 aa  88.6  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 194 aa  87.8  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 190 aa  87.8  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 187 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 201 aa  85.9  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  31.67 
 
 		 185 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 201 aa  85.9  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 201 aa  85.5  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5255  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 196 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5634  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 196 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5344  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 196 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772275  normal  0.605205 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 203 aa  85.5  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 216 aa  85.1  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 202 aa  85.1  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5689  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 219 aa  85.1  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.784661  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1393  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 205 aa  84.7  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 195 aa  84.3  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 206 aa  84.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 195 aa  84.3  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 206 aa  84.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 206 aa  84.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  31.74 
 
 		 185 aa  84.3  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3232  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1089  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0051  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0191549  normal  0.55733 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2898  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.881728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4828  transcriptional regulator, TetR family  39.69 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03760  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.599281  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2807  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3169  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0031  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1735  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3628  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
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NC_012669  Bcav_0135  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003296  RS03014  putative transcription regulator protein  33.97 
 
 		 216 aa  81.3  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.262128 
 
 
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NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 210 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 202 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009511  Swit_3569  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 217 aa  81.3  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  1 
 
 
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NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
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NC_010551  BamMC406_0430  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.469108 
 
 
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NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_3614  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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