More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0051 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0051  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 192 aa  379  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0191549  normal  0.55733 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  53.8 
 
 		 197 aa  154  9e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03760  transcriptional regulator, TetR family  44.86 
 
 		 201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.599281  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  48.47 
 
 		 191 aa  134  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31550  transcriptional regulator  43.98 
 
 		 191 aa  122  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  41.21 
 
 		 198 aa  103  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.792237 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4955  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 218 aa  102  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00123858  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 202 aa  99  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 189 aa  96.7  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 189 aa  94.4  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  39.31 
 
 		 191 aa  93.2  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3360  TetR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 197 aa  92.4  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  32.92 
 
 		 189 aa  92.8  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 200 aa  92  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3569  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 217 aa  92  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 188 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 257 aa  91.7  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1896  transcriptional regulator, TetR family  42.4 
 
 		 196 aa  90.5  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.589186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2890  TetR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 202 aa  90.9  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 188 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 204 aa  89.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 194 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8687  transcriptional regulator, TetR family  38.22 
 
 		 176 aa  89.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 206 aa  89  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 222 aa  87.8  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 215 aa  87.4  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 211 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 189 aa  86.7  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 206 aa  85.9  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  40.13 
 
 		 188 aa  85.1  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0474  transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 		 234 aa  85.1  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 206 aa  85.1  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 206 aa  85.1  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1089  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 212 aa  84.7  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2930  transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0430  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4372  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1385  transcriptional regulator, TetR family  39.35 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2898  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 206 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.881728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1790  TetR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0306  transcriptional regulator, TetR family  40.65 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.278171  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 190 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 190 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0127  transcriptional regulator, TetR family  37.99 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00410003  normal  0.28897 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8504  putative transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0193  TetR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5689  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.784661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03014  putative transcription regulator protein  38.75 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0135  transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 		 181 aa  77  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1985  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3878  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0990278  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  37.42 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13194  TetR/AcrR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.338711 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0394  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509635  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2832  transcriptional regulator, TetR family  40.48 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3995  regulatory protein, TetR  37.61 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3967  transcriptional regulator, TetR family  38.02 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0630357 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3853  transcriptional regulator, TetR family  38.02 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.26442  normal  0.765649 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_3628  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 214 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 214 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5634  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2299  TetR family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.633617  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2807  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_3169  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_5255  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_5344  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772275  normal  0.605205 
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A0031  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A1735  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
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NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
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NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  34.59 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
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NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  35.19 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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