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for query gene Pput_3566 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 187 aa  387  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2898  TetR family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 206 aa  120  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.881728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0430  TetR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 207 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 206 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 206 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 206 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 206 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  39.88 
 
 		 179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 222 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03760  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 201 aa  111  8.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.599281  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  36.31 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.792237 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 215 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  36.61 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 194 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 188 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2299  TetR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 201 aa  105  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.633617  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  36.11 
 
 		 185 aa  104  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  104  9e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31550  transcriptional regulator  33.71 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 214 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3614  TetR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 218 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 216 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  38.22 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3628  TetR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 214 aa  101  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 188 aa  101  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3169  TetR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 214 aa  101  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2807  TetR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 214 aa  101  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0031  TetR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 214 aa  101  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1735  TetR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 214 aa  101  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 208 aa  100  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 201 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3878  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 200 aa  99.8  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0990278  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 210 aa  99  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 179 aa  99  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0306  transcriptional regulator, TetR family  38.22 
 
 		 186 aa  99  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.278171  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 201 aa  99  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 192 aa  99  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 201 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 211 aa  98.6  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 189 aa  97.8  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 192 aa  97.8  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 201 aa  97.8  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1089  TetR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 212 aa  97.1  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2930  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 193 aa  97.4  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 181 aa  96.3  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 203 aa  96.3  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 204 aa  95.9  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 197 aa  95.5  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 210 aa  95.1  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0474  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 234 aa  94.7  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1449  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 203 aa  94.7  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126985  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 191 aa  94.7  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 206 aa  94.7  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0101  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3569  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 217 aa  93.2  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1896  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 196 aa  92.4  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.589186 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 205 aa  91.7  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 205 aa  91.7  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 205 aa  91.7  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 205 aa  91.7  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2399  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 190 aa  92  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2446  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 190 aa  92  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200805  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 257 aa  92  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 205 aa  91.7  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 205 aa  91.7  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 205 aa  91.7  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 190 aa  91.7  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 189 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2440  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 190 aa  90.9  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 189 aa  90.5  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 202 aa  90.5  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 188 aa  89.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 188 aa  89.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4372  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 187 aa  89.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 202 aa  89.4  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 221 aa  88.6  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 204 aa  88.6  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 		 183 aa  88.2  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 202 aa  88.2  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 205 aa  88.2  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3232  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 204 aa  87.8  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 197 aa  87.8  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal  1 
 
 
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NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 189 aa  87.8  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001160  transcriptional regulator  32.18 
 
 		 181 aa  87  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010678  Rpic_3853  transcriptional regulator, TetR family  40.99 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.26442  normal  0.765649 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 202 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
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