More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1405 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
203 aa  407  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  50.81 
 
 
197 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  50.81 
 
 
197 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  47.2 
 
 
222 aa  154  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 
215 aa  150  8e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3569  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
217 aa  150  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  47.44 
 
 
206 aa  147  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  47.44 
 
 
206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  44.81 
 
 
207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  47.44 
 
 
206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  47.44 
 
 
206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0430  TetR family transcriptional regulator  48.37 
 
 
207 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2299  TetR family transcriptional regulator  47.49 
 
 
201 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.633617  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  48.37 
 
 
207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0306  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 
186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.278171  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2898  TetR family transcriptional regulator  46.79 
 
 
206 aa  142  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.881728  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3853  transcriptional regulator, TetR family  50.62 
 
 
213 aa  140  9e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.26442  normal  0.765649 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3967  transcriptional regulator, TetR family  50.62 
 
 
213 aa  140  9e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0630357 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3614  TetR family transcriptional regulator  48.54 
 
 
218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  48.05 
 
 
211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  48.7 
 
 
216 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03014  putative transcription regulator protein  48.77 
 
 
216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3628  TetR family transcriptional regulator  47.95 
 
 
214 aa  138  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  47.95 
 
 
214 aa  138  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2807  TetR family transcriptional regulator  47.95 
 
 
214 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3169  TetR family transcriptional regulator  47.95 
 
 
214 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1735  TetR family transcriptional regulator  47.95 
 
 
214 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0031  TetR family transcriptional regulator  47.95 
 
 
214 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1089  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 
212 aa  125  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4828  transcriptional regulator, TetR family  40.49 
 
 
207 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  44.77 
 
 
189 aa  121  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  40.76 
 
 
195 aa  118  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  40.13 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  38.25 
 
 
188 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  38.25 
 
 
188 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 
192 aa  111  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  35.5 
 
 
189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  42.77 
 
 
179 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
257 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
201 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 
191 aa  108  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  39.41 
 
 
201 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  35.5 
 
 
189 aa  107  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 
194 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  39.41 
 
 
201 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  39.87 
 
 
187 aa  106  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
188 aa  105  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
194 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
188 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 
194 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 
190 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 
202 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  40.83 
 
 
201 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
202 aa  102  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
190 aa  101  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  40.83 
 
 
201 aa  101  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 
201 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5286  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
196 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  39.79 
 
 
208 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8687  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 
176 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
186 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  38.73 
 
 
201 aa  99.8  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 
189 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  39.86 
 
 
191 aa  99  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 
194 aa  99  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 
202 aa  98.2  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1449  transcriptional regulator, TetR family  42.14 
 
 
203 aa  98.2  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126985  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1790  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
209 aa  98.2  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 
196 aa  97.4  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1985  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 
206 aa  97.1  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  39.64 
 
 
204 aa  97.1  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6699  transcriptional regulator, TetR family  36.16 
 
 
207 aa  96.3  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.678516  normal  0.427356 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 
204 aa  97.1  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  39.64 
 
 
204 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  40.49 
 
 
205 aa  95.9  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  39.88 
 
 
221 aa  95.5  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
203 aa  95.5  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
202 aa  95.5  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 
189 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3360  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 
197 aa  95.1  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4372  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 
187 aa  95.1  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  34.66 
 
 
202 aa  95.1  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 
192 aa  94.7  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5107  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
225 aa  94.7  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.346129  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  39.35 
 
 
183 aa  93.2  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  38.32 
 
 
221 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 
200 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 
202 aa  93.2  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 
179 aa  92  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  38.61 
 
 
228 aa  92  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 
197 aa  92  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 
197 aa  91.7  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2965  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 
175 aa  91.7  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  43.31 
 
 
210 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 
185 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
184 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
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NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  35.15 
 
 
185 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 
187 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal 
 
 
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