More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6699 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6699  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
207 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.678516  normal  0.427356 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5796  transcriptional regulator, TetR family  94.69 
 
 
207 aa  374  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0048122 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1089  TetR family transcriptional regulator  43.65 
 
 
212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 
206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0430  TetR family transcriptional regulator  39.49 
 
 
207 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  39.49 
 
 
207 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  38.51 
 
 
206 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  38.51 
 
 
206 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2898  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
206 aa  112  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.881728  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  38.51 
 
 
206 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  36.97 
 
 
211 aa  109  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  36.09 
 
 
203 aa  108  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
216 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
222 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  40.12 
 
 
215 aa  106  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03014  putative transcription regulator protein  38.36 
 
 
216 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 
197 aa  98.6  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 
197 aa  98.2  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
207 aa  98.2  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3614  TetR family transcriptional regulator  40.25 
 
 
218 aa  95.9  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  40.25 
 
 
214 aa  95.9  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2299  TetR family transcriptional regulator  38.42 
 
 
201 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.633617  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3628  TetR family transcriptional regulator  40.25 
 
 
214 aa  95.5  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  41.25 
 
 
198 aa  94.7  8e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.792237 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2807  TetR family transcriptional regulator  40.25 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3169  TetR family transcriptional regulator  40.25 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0031  TetR family transcriptional regulator  40.25 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1735  TetR family transcriptional regulator  40.25 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3569  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
217 aa  92.8  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
187 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0306  transcriptional regulator, TetR family  38.12 
 
 
186 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.278171  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  36.48 
 
 
179 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 
201 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3853  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 
213 aa  85.5  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.26442  normal  0.765649 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5634  TetR family transcriptional regulator  37.13 
 
 
196 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3967  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 
213 aa  85.5  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0630357 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 
201 aa  85.5  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 
201 aa  85.1  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
200 aa  85.1  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 
202 aa  85.1  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
190 aa  84.7  8e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31550  transcriptional regulator  34.86 
 
 
191 aa  85.1  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5255  TetR family transcriptional regulator  37.13 
 
 
196 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5344  TetR family transcriptional regulator  37.13 
 
 
196 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772275  normal  0.605205 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
202 aa  84  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 
197 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
200 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13194  TetR/AcrR family transcriptional regulator  35.84 
 
 
200 aa  81.3  0.000000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.338711 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5286  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
196 aa  80.9  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  35.5 
 
 
191 aa  80.1  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
196 aa  79.7  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 
190 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1327  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 
204 aa  79.7  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15266  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03760  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 
201 aa  79  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.599281  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 
204 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  36.53 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1393  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3232  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 
204 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8504  putative transcriptional regulator, TetR family  36.72 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 
184 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
192 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  39.6 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  35.48 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
194 aa  72.4  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4955  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 
218 aa  71.2  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00123858  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 
181 aa  70.9  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0309  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
184 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.312076  normal  0.149076 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
196 aa  71.2  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 
194 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0051  transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0191549  normal  0.55733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 
183 aa  70.1  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1449  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126985  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8687  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1572  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6259  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6735  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3360  TetR family transcriptional regulator  36.88 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 
187 aa  68.6  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5689  transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 
219 aa  68.2  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.784661  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2890  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
202 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
194 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
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NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
194 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
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NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
195 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
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NC_011666  Msil_1985  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
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NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal 
 
 
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NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
195 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal 
 
 
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NC_010335  Caul_5107  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.346129  normal 
 
 
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NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 
188 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00777364 
 
 
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