More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0309 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0309  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
184 aa  372  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.312076  normal  0.149076 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0368  TetR family transcriptional regulator  67.4 
 
 
184 aa  257  5.0000000000000005e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00011837  normal  0.0425 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 
190 aa  123  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
200 aa  97.1  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 
206 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  33.73 
 
 
185 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
206 aa  95.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
206 aa  95.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
197 aa  94.4  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 
196 aa  94.4  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1089  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
212 aa  94  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2898  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 
206 aa  94  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.881728  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
197 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
206 aa  92  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0430  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 
207 aa  91.3  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 
207 aa  91.7  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
207 aa  91.3  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  32.53 
 
 
185 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
203 aa  89.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
215 aa  88.6  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 
206 aa  87.8  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 
211 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2299  TetR family transcriptional regulator  32.9 
 
 
201 aa  84.7  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.633617  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
222 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 
192 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 
191 aa  81.3  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0306  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.278171  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  33.99 
 
 
195 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
195 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4372  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
216 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 
197 aa  79  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 
201 aa  79  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 
190 aa  79  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 
181 aa  78.6  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 
189 aa  78.2  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13194  TetR/AcrR family transcriptional regulator  32.42 
 
 
200 aa  77.8  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.338711 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
228 aa  77.8  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  29.68 
 
 
201 aa  77.8  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5255  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 
196 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8687  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 
176 aa  77  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5344  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 
196 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772275  normal  0.605205 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 
201 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5634  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 
196 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3569  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
217 aa  76.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2832  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5107  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.346129  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 
179 aa  72  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3628  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
214 aa  72  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 
188 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 
200 aa  71.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2807  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
214 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2816  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
192 aa  71.2  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1735  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
214 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3169  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
214 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0031  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
214 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3614  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
218 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
214 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 
205 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 
205 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 
205 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  26.34 
 
 
198 aa  70.9  0.000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.792237 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 
205 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 
205 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 
205 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 
205 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  29.67 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6699  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.678516  normal  0.427356 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
194 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5286  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 
196 aa  70.1  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03760  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.599281  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0051  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0191549  normal  0.55733 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
257 aa  68.6  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
221 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
192 aa  67.4  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 
210 aa  67  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3722  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
189 aa  67  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03014  putative transcription regulator protein  32.67 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5796  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0048122 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3853  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 
213 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.26442  normal  0.765649 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3967  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 
213 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0630357 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>