More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1327 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1327  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  412  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5286  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3569  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 217 aa  123  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2299  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.633617  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0306  transcriptional regulator, TetR family  37.22 
 
 		 186 aa  99  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.278171  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1089  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 212 aa  94.7  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 216 aa  88.2  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 197 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  35.39 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 197 aa  85.9  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 206 aa  84.7  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 206 aa  84.7  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0430  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03014  putative transcription regulator protein  38.04 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2898  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.881728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6699  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.678516  normal  0.427356 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5107  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.346129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5796  transcriptional regulator, TetR family  34.75 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0048122 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  34.97 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.792237 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 197 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3614  TetR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3628  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3169  TetR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2807  TetR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0031  TetR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1735  TetR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3967  transcriptional regulator, TetR family  33.95 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0630357 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3853  transcriptional regulator, TetR family  33.95 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.26442  normal  0.765649 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31550  transcriptional regulator  29.68 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34730  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  36.79 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4955  transcriptional regulator, TetR family  62 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00123858  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3360  TetR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  29.7 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1449  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126985  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5133  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  28.26 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4828  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0474  transcriptional regulator, TetR family  39.6 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1333  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2437  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2816  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  25.99 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03760  transcriptional regulator, TetR family  51.79 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.599281  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal  1 
 
 
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NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.620771 
 
 
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NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_1790  TetR family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
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NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
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NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal  1 
 
 
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NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
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NC_013037  Dfer_3428  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0832031  normal  1 
 
 
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NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  37 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  41.46 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 273 aa  54.7  0.0000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_5634  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.405857 
 
 
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NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
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NC_011666  Msil_1985  transcriptional regulator, TetR family  48.94 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_5255  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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