More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2650 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 211 aa  430  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  45.19 
 
 		 209 aa  174  8e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  35.12 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 209 aa  95.5  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 209 aa  95.5  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3801  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 206 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.657762 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5460  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 206 aa  92.8  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3604  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.657199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4643  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609609  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3720  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0838127 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5007  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 239 aa  89.4  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2388  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1764  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.162555 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  30.46 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2584  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.130445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  25.63 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  24.62 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  25.74 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25250  transcriptional regulator  24.08 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.862967  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2832  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 189 aa  62  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 210 aa  62  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 237 aa  61.6  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2865  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  47.62 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3703  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00019277  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4128  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3280  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0233273  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1614  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0287431  hitchhiker  0.0000000422838 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  33.72 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1775  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3612  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000248131  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 199 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3621  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265617  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  37.84 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 497 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3389  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 241 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3352  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 241 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000543998  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3301  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00420506  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  33.72 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  25.24 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3654  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.786622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3605  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.02462e-25 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  23.2 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  25.36 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>