135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3536 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3536  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  384  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3685  putative transcriptional regulator  71.2 
 
 		 191 aa  279  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0732  putative transcriptional regulator  71.2 
 
 		 191 aa  279  2e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00595683  decreased coverage  0.00650584 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3832  putative transcriptional regulator  71.2 
 
 		 191 aa  279  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3411  putative transcriptional regulator  68.59 
 
 		 191 aa  274  6e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.879169  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0721  putative transcriptional regulator  70.16 
 
 		 191 aa  272  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0502  putative transcriptional regulator  70.16 
 
 		 191 aa  271  3e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0402  putative transcriptional regulator  65.45 
 
 		 196 aa  255  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.314976  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4683  putative transcriptional regulator  61.26 
 
 		 191 aa  243  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4740  putative transcriptional regulator  61.26 
 
 		 191 aa  243  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.76084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4592  putative transcriptional regulator  61.26 
 
 		 191 aa  243  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.457943  normal  0.315374 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4718  putative transcriptional regulator  61.26 
 
 		 191 aa  243  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.172421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4600  putative transcriptional regulator  60.73 
 
 		 191 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0322  putative transcriptional regulator  60.21 
 
 		 191 aa  239  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000306279 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04005  predicted transcriptional regulator  59.69 
 
 		 191 aa  238  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3857  transcriptional regulator, TetR family  59.69 
 
 		 191 aa  238  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03967  hypothetical protein  59.69 
 
 		 191 aa  238  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4376  putative transcriptional regulator  59.69 
 
 		 191 aa  238  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00211026  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4690  putative transcriptional regulator  59.69 
 
 		 191 aa  238  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3877  putative transcriptional regulator  59.69 
 
 		 191 aa  238  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.859498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4664  putative transcriptional regulator  59.69 
 
 		 191 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5651  putative transcriptional regulator  59.69 
 
 		 191 aa  238  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000374909  normal  0.719853 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4604  putative transcriptional regulator  59.69 
 
 		 191 aa  237  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000800065  normal  0.777869 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3701  transcriptional regulator of TetR family protein  34.62 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  28.18 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  27.62 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  22.36 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  25.84 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1527  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  23.6 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.718491  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  27.1 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  26.58 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31550  transcriptional regulator  25.32 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 186 aa  52  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3878  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0990278  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 		 197 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 257 aa  49.3  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  24.08 
 
 		 188 aa  49.3  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 201 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0368  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 184 aa  48.9  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00011837  normal  0.0425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2697  transcriptional regulator, TetR family  21.92 
 
 		 202 aa  48.5  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2694  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 203 aa  48.5  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0309  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 184 aa  48.1  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.312076  normal  0.149076 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 191 aa  48.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 201 aa  47.8  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 184 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0101  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  21.69 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2930  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 201 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  21.93 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  21.69 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  25.49 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 229 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2864  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.037684 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  21.56 
 
 		 204 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 179 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1449  transcriptional regulator, TetR family  24.27 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126985  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  21.6 
 
 		 194 aa  45.4  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 204 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48190  putative transcriptional regulator  24.46 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114913  normal  0.0538885 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0992  putative transcriptional regulator of paa operon  32.97 
 
 		 208 aa  45.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.332152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 197 aa  45.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0894  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 260 aa  45.4  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2898  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.881728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 205 aa  45.4  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 197 aa  45.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0620  TetR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 210 aa  44.7  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 188 aa  44.7  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  24.72 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.792237 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  22.53 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  21.69 
 
 		 221 aa  43.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  26.47 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2762  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1901  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.665453  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>