125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0402 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0402  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 196 aa  394  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.314976  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3685  putative transcriptional regulator  79.58 
 
 		 191 aa  306  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0732  putative transcriptional regulator  79.58 
 
 		 191 aa  306  1.0000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00595683  decreased coverage  0.00650584 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3832  putative transcriptional regulator  79.58 
 
 		 191 aa  306  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0502  putative transcriptional regulator  65.97 
 
 		 191 aa  260  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0721  putative transcriptional regulator  66.49 
 
 		 191 aa  258  3e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3536  putative transcriptional regulator  65.45 
 
 		 191 aa  255  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3411  putative transcriptional regulator  62.83 
 
 		 191 aa  251  5.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.879169  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4683  putative transcriptional regulator  61.26 
 
 		 191 aa  245  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04005  predicted transcriptional regulator  61.26 
 
 		 191 aa  244  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3857  transcriptional regulator, TetR family  61.26 
 
 		 191 aa  244  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4376  putative transcriptional regulator  61.26 
 
 		 191 aa  244  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00211026  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4690  putative transcriptional regulator  61.26 
 
 		 191 aa  244  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3877  putative transcriptional regulator  61.26 
 
 		 191 aa  244  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.859498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4604  putative transcriptional regulator  61.26 
 
 		 191 aa  244  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000800065  normal  0.777869 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4664  putative transcriptional regulator  61.26 
 
 		 191 aa  244  4.9999999999999997e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5651  putative transcriptional regulator  61.26 
 
 		 191 aa  244  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000374909  normal  0.719853 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03967  hypothetical protein  61.26 
 
 		 191 aa  244  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4600  putative transcriptional regulator  61.26 
 
 		 191 aa  244  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0322  putative transcriptional regulator  60.73 
 
 		 191 aa  244  6.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000306279 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4592  putative transcriptional regulator  61.26 
 
 		 191 aa  244  9e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.457943  normal  0.315374 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4718  putative transcriptional regulator  61.26 
 
 		 191 aa  244  9e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.172421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4740  putative transcriptional regulator  61.26 
 
 		 191 aa  243  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.76084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3701  transcriptional regulator of TetR family protein  28.57 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  28.73 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  30.22 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 190 aa  67  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  25.7 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  23.2 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 191 aa  62  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2832  transcriptional regulator, TetR family  25.99 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  26.92 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3995  regulatory protein, TetR  31.4 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3878  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0990278  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  22.91 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  22.35 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  25.86 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31550  transcriptional regulator  22.78 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  25.28 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 192 aa  52.4  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  24.18 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 183 aa  52  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 179 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 201 aa  51.6  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 201 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1527  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  19.66 
 
 		 185 aa  51.6  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.718491  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  24.72 
 
 		 201 aa  51.2  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0309  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 184 aa  51.2  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.312076  normal  0.149076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  21.35 
 
 		 257 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1449  transcriptional regulator, TetR family  23.86 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126985  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 210 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  23.38 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  25.32 
 
 		 204 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0368  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00011837  normal  0.0425 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5133  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4472  transcriptional regulator, TetR family  25.16 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.590949  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 208 aa  49.3  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  24.52 
 
 		 189 aa  48.9  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2306  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 189 aa  48.9  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2816  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 192 aa  48.1  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 205 aa  48.1  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 205 aa  48.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 205 aa  48.1  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 205 aa  48.1  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 205 aa  48.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 205 aa  48.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 205 aa  48.1  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8687  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  29.41 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4188  hypothetical protein  29 
 
 		 169 aa  47.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5689  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.784661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2890  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0550  regulatory protein, TetR  22.29 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  20.56 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  21.93 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3569  TetR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  21.98 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0803  transcriptional regulator, TetR family  24.76 
 
 		 174 aa  45.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 206 aa  45.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>