176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2559 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2559  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 191 aa  377  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01911  putative transcription regulator protein  59.78 
 
 		 191 aa  207  6e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0303213 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0685  TetR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 192 aa  166  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111634 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6284  regulatory protein, TetR  47.57 
 
 		 195 aa  159  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  44.32 
 
 		 196 aa  129  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0798  transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 193 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0726  regulatory protein TetR  38.29 
 
 		 200 aa  122  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  43.02 
 
 		 189 aa  121  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2720  TetR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 194 aa  111  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532546  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2764  TetR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 194 aa  111  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2750  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 194 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209675  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3287  TetR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 194 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3009  TetR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101347  normal  0.721246 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0581  putative transcriptional regulator  33.16 
 
 		 189 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 191 aa  93.6  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5671  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 190 aa  92.8  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2194  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 203 aa  89.7  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.285199  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 205 aa  88.6  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06210  putative transcriptional regulator  32.09 
 
 		 189 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0238159 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3237  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 193 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0582489  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 186 aa  85.9  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5685  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 193 aa  85.1  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4649  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.490512  normal  0.521268 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5306  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5395  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488916  normal  0.171159 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2958  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0440878  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4071  putative transcriptional regulator, TetR family  34.3 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294777  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4133  transcriptional regulator, TetR family  35.6 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0216  TetR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0735  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177644  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2924  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0274  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6109  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617571  normal  0.147608 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1963  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0913  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.457382 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5870  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1060  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  22.87 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0275  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7842  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341573  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7205  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9229  transcriptional regulator TetR family  27.6 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3295  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 185 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3422  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 187 aa  52  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0973  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 215 aa  51.6  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269206  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  21.61 
 
 		 198 aa  50.4  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  30.39 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  21.08 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3194  transcriptional regulator, TetR family  21 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0856  TetR family transcriptional regulator  20.5 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.257581  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  30.68 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0955  TetR family transcriptional regulator  21.08 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3212  transcriptional regulator, TetR family  21 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3236  transcriptional regulator, TetR family  21.5 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0469246  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0676  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.49013  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2134  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 186 aa  48.5  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146337 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2970  TetR family transcriptional regulator  20.5 
 
 		 194 aa  48.1  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  20.57 
 
 		 186 aa  47.8  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  23.56 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2926  TetR family transcriptional regulator  20.5 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529467  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2044  transcriptional regulator, TetR family  20.5 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.505226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6399  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147882 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1604  AcrR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388293  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3102  regulatory protein TetR  30 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal  0.6435 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2050  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 212 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274298  normal  0.196014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1925  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 212 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00396712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0245  transcriptional regulator  22.41 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5890  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 209 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223104  normal  0.394498 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3160  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 205 aa  45.8  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000883166 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2155  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 212 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 228 aa  46.2  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 212 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2339  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.519522  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>