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for query gene Vapar_6080 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012792  Vapar_6080  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
199 aa  395  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1293  TetR family transcriptional regulator  81.91 
 
 
199 aa  323  7e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0107  TetR family transcriptional regulator  80.9 
 
 
199 aa  311  4.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.267531  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4385  TetR family transcriptional regulator  77.39 
 
 
201 aa  301  6.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6204  transcriptional regulator, TetR family  79.59 
 
 
199 aa  289  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308886  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0303  TetR family transcriptional regulator  68.34 
 
 
228 aa  257  8e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402109  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0035  TetR family transcriptional regulator  56.59 
 
 
206 aa  180  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00656395  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3096  TetR family transcriptional regulator  43.32 
 
 
213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.631067  normal  0.061558 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3941  transcriptional regulator, TetR family  41.71 
 
 
222 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5130  TetR family transcriptional regulator  41.01 
 
 
203 aa  123  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943479  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0741  regulatory protein, TetR  39.46 
 
 
211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4347  transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 
190 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1766  TetR family transcriptional regulator  37.16 
 
 
196 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0390977  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0696  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 
194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3303  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.808306 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3577  TetR family transcriptional regulator  41.61 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2116  TetR family transcriptional regulator  38.5 
 
 
218 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2563  TetR family transcriptional regulator  35.52 
 
 
192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227827  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6078  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0977252 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0427  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 
180 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8534  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 
201 aa  105  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3233  TetR family transcriptional regulator  36.52 
 
 
193 aa  105  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.659753 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1426  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 
190 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.620095 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2320  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
195 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 
192 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 
192 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 
196 aa  101  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6146  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 
195 aa  101  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5150  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
204 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491017  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2973  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 
211 aa  98.6  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0965425 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1101  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
188 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205673  normal  0.0164026 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4903  putative TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 
200 aa  96.7  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021531  normal  0.0222673 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3184  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
186 aa  96.7  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4120  transcriptional regulator, TetR family  35.36 
 
 
180 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3797  regulatory protein TetR  35.36 
 
 
180 aa  95.1  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.350305  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4582  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
191 aa  95.1  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.278118  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5678  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
200 aa  95.1  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.67022 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4322  TetR family transcriptional regulator  36.98 
 
 
198 aa  94.7  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136212  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0195  TetR family transcriptional regulator  33.69 
 
 
194 aa  94.4  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.5282  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1602  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 
191 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0084  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0114  transcriptional regulator, TetR family  34.2 
 
 
197 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13405  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2526  TetR family transcriptional regulator  34.24 
 
 
252 aa  94  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6000  TetR family transcriptional regulator  36.57 
 
 
180 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513273  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2480  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 
198 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2017  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 
184 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.93886 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0171  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 
189 aa  91.3  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3493  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 
193 aa  91.3  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.74894  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5405  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 
195 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4813  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
195 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800631  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5456  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 
195 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.31437 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2276  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
182 aa  90.1  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63880  putative transcriptional regulator  35.29 
 
 
186 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2168  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
188 aa  90.1  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5358  transcriptional regulator, TetR family  38.41 
 
 
196 aa  89.4  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2880  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
187 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.924779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6374  putative transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 
191 aa  88.6  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4037  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 
185 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0431559  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1188  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 
193 aa  87.4  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4962  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 
196 aa  87.8  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0320648  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2810  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 
187 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4737  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
209 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.838213 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28320  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 
193 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.115035  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3648  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
204 aa  86.3  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2902  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 
187 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.465511  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3608  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
198 aa  86.3  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2719  regulatory protein, TetR  34.59 
 
 
193 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111608  normal  0.97579 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2172  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 
185 aa  85.5  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046251 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1404  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 
193 aa  85.1  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2441  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 
193 aa  84.7  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.509096 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3406  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2933  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0101224  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6064  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
192 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  35.23 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2057  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 
191 aa  82  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4799  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 
195 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2384  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
187 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5341  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
194 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601109  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3383  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 
197 aa  81.3  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.606536  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6328  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 
199 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00138827  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4587  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 
199 aa  79.7  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358268  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5097  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 
199 aa  79.7  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2626  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
188 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5143  transcriptional regulator  31.9 
 
 
200 aa  79  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.269687  normal  0.0526166 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0539  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0030  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 
196 aa  78.6  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100703  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2347  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal  0.0620265 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1974  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36617  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0298  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 
198 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2995  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
205 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3906  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0242743  normal 
 
 
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NC_013131  Caci_2699  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 
197 aa  74.7  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009656  PSPA7_5550  TetR family transcriptional regulator  39.25 
 
 
190 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1617  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2005  transcriptional regulator, TetR family  40.5 
 
 
193 aa  73.6  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.848045  normal 
 
 
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NC_004578  PSPTO_1758  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_1879  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009080  BMA10247_1392  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.637203  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_2503  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A2118  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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