More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3452 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 205 aa  414  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5671  transcriptional regulator, TetR family  48.66 
 
 		 190 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  43.17 
 
 		 186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 194 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5685  TetR family transcriptional regulator  42.69 
 
 		 193 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5395  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 193 aa  132  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488916  normal  0.171159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5306  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 193 aa  132  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  40.64 
 
 		 189 aa  131  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3237  TetR family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 193 aa  131  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0582489  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  39.89 
 
 		 193 aa  125  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  39.08 
 
 		 191 aa  125  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4649  transcriptional regulator, TetR family  40.11 
 
 		 186 aa  124  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.490512  normal  0.521268 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2924  regulatory protein TetR  39.08 
 
 		 204 aa  121  8e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  38.86 
 
 		 193 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 192 aa  119  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4071  putative transcriptional regulator, TetR family  36.57 
 
 		 193 aa  118  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294777  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  41.9 
 
 		 188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3287  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2764  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 194 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2750  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 194 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209675  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2720  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 194 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532546  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6284  regulatory protein, TetR  34.05 
 
 		 195 aa  105  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 191 aa  105  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  32.29 
 
 		 194 aa  101  6e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 197 aa  101  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 205 aa  101  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06210  putative transcriptional regulator  33.89 
 
 		 189 aa  101  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0238159 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0581  putative transcriptional regulator  35.06 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01911  putative transcription regulator protein  32.12 
 
 		 191 aa  97.4  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0303213 
 
 
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NC_008726  Mvan_3009  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 199 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101347  normal  0.721246 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0685  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 192 aa  93.2  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111634 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0726  regulatory protein TetR  34.83 
 
 		 200 aa  92.4  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 202 aa  88.6  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2559  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 191 aa  88.6  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0735  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 212 aa  88.2  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177644  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 196 aa  84.7  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0274  transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 		 193 aa  84.7  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  25.84 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1963  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9229  transcriptional regulator TetR family  29.78 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
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NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
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NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013235  Namu_0798  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
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NC_010581  Bind_0275  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008392  Bamb_6109  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617571  normal  0.147608 
 
 
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NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5870  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  24.62 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0973  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269206  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4133  transcriptional regulator, TetR family  28.73 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 212 aa  72  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
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NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  29.67 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  23.41 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2475  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000212819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0287  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000147212 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1060  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  30 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  29.05 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2194  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.285199  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1582  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000313158  n/a   
 
 
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NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
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NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
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NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  26.84 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  24.59 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  23.46 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007954  Sden_1388  regulatory protein, TetR  24.56 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  25.86 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6399  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147882 
 
 
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NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
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NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  28.78 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_0216  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_1097  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_0913  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.457382 
 
 
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NC_012912  Dd1591_2057  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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