286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5395 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5306  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  391  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5395  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  391  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488916  normal  0.171159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5685  TetR family transcriptional regulator  98.96 
 
 		 193 aa  387  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  90.66 
 
 		 194 aa  337  7e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3237  TetR family transcriptional regulator  76.72 
 
 		 193 aa  294  4e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0582489  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5671  transcriptional regulator, TetR family  44.92 
 
 		 190 aa  141  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2924  regulatory protein TetR  41.71 
 
 		 204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 193 aa  99.4  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6284  regulatory protein, TetR  34.83 
 
 		 195 aa  91.7  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4071  putative transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 193 aa  91.3  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294777  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 		 186 aa  89  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 192 aa  88.2  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 193 aa  87.8  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 191 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 193 aa  84.7  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  31.89 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2559  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4649  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.490512  normal  0.521268 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0685  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111634 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_003296  RS01911  putative transcription regulator protein  31.79 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0303213 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0726  regulatory protein TetR  31.55 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 215 aa  72  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2750  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209675  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  28.32 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2720  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532546  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2764  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  30 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3009  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 199 aa  64.3  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101347  normal  0.721246 
 
 
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NC_009656  PSPA7_0581  putative transcriptional regulator  30.54 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1963  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 190 aa  62  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0973  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269206  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0735  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177644  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06210  putative transcriptional regulator  29.34 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0238159 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3287  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0274  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0913  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.457382 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0798  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  24.73 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1060  transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5870  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0275  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6109  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617571  normal  0.147608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  25.57 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9229  transcriptional regulator TetR family  29.19 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  25.95 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4749  TetR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 186 aa  52  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2194  transcriptional regulator, TetR family  22.41 
 
 		 203 aa  51.2  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.285199  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6399  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 193 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147882 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 225 aa  51.2  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 192 aa  51.2  0.000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  25.41 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5526  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
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NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
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NC_008544  Bcen2424_5890  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223104  normal  0.394498 
 
 
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NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  26.82 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 		 204 aa  49.7  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
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NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
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NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
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NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 195 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
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NC_011885  Cyan7425_0008  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.643837 
 
 
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NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  22.1 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 200 aa  49.3  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
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NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 214 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 206 aa  48.9  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_010002  Daci_5678  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67022 
 
 
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NC_011757  Mchl_3422  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 187 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal  1 
 
 
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