More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2580 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  436  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 193 aa  94.4  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 196 aa  90.5  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 213 aa  85.9  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 215 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 206 aa  72  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 206 aa  72  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 211 aa  71.2  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  28.57 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  23.67 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  28.64 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  21.54 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1493  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1408  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0121  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1058  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0974  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.543907  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0527  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.474473  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2293  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 247 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.887651  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4138  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 191 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  28.06 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1329  transcriptional regulator, TetR family  23.76 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.851315 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2564  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1872  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0047199  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1763  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139552  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  32.06 
 
 		 183 aa  67  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0985  transcriptional regulator, TetR family  24.88 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1702  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  27.52 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1255  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1146  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  22.8 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3816  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0181155  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48190  putative transcriptional regulator  27.89 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114913  normal  0.0538885 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  28.05 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3608  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  23.73 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0162  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 201 aa  62  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 212 aa  62  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2361  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0020  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 246 aa  61.6  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.390674  normal  0.0209926 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  33.33 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  32.46 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  32.46 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  33.33 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  32.46 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1991  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000115862  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1726  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.716564  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1980  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00264568  hitchhiker  0.00106159 
 
 
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NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  26.6 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_1549  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal  1 
 
 
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NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  32.46 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008345  Sfri_3993  transcriptional regulator, TetR family protein  23.56 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000102791  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E1841  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.170954  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
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NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_2203  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0627793  hitchhiker  0.000036044 
 
 
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NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
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