More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4778 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 227 aa  451  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  61.65 
 
 		 221 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  50.48 
 
 		 214 aa  191  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  51.58 
 
 		 212 aa  188  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 186 aa  184  9e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 212 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 186 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  47.12 
 
 		 219 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  47.09 
 
 		 211 aa  168  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 212 aa  168  7e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  47.12 
 
 		 209 aa  167  9e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 210 aa  166  4e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  45.13 
 
 		 219 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  45.99 
 
 		 179 aa  157  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  47.18 
 
 		 204 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4476  TetR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 220 aa  155  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182515 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  40.31 
 
 		 213 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  39.62 
 
 		 222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 214 aa  148  8e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  34.67 
 
 		 198 aa  145  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 196 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 193 aa  132  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4749  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2969  hypothetical protein  45.16 
 
 		 162 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448916  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 196 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  37.17 
 
 		 192 aa  112  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 205 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 191 aa  105  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  33.18 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1991  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 199 aa  102  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000115862  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1980  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 199 aa  102  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00264568  hitchhiker  0.00106159 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1726  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 199 aa  102  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.716564  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1841  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 199 aa  102  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.170954  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1797  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0497705  normal  0.0268872 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1860  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0204447  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2361  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 199 aa  99  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1549  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 199 aa  98.2  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  32.63 
 
 		 200 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  38.51 
 
 		 197 aa  97.4  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 209 aa  95.9  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 190 aa  95.9  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 206 aa  95.1  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 206 aa  95.1  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1534  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 199 aa  94.7  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.239413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1607  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 199 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1547  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 199 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1906  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 199 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 193 aa  93.6  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1737  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 199 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.151738  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4102  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 190 aa  92.4  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 176 aa  90.9  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2564  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  91.3  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1872  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0047199  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1763  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139552  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2203  TetR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 206 aa  91.3  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0627793  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 206 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  32.51 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  28.14 
 
 		 199 aa  90.1  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53410  transcriptional regulator  32.49 
 
 		 196 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.733487  normal  0.037637 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 206 aa  88.2  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 200 aa  87.8  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 194 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4681  transcriptional regulator  31.98 
 
 		 196 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 194 aa  87  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 206 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 206 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 206 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0971  TetR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 200 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.325702 
 
 
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CP001509  ECD_01619  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.98 
 
 		 171 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000798557  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01609  hypothetical protein  28.98 
 
 		 171 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000476829  n/a   
 
 
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NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 212 aa  85.1  9e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011663  Sbal223_0268  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 198 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008781  Pnap_0162  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 201 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008345  Sfri_3993  transcriptional regulator, TetR family protein  30.68 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000102791  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  30.96 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
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NC_009997  Sbal195_0272  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009665  Shew185_0264  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009052  Sbal_0272  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007650  BTH_II1702  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 311 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
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NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146337 
 
 
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NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  26.46 
 
 		 193 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_2475  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000212819  normal  1 
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_1097  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
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