More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_53410 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_53410  transcriptional regulator  100 
 
 		 196 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.733487  normal  0.037637 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4681  transcriptional regulator  96.94 
 
 		 196 aa  384  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0971  TetR family transcriptional regulator  70.41 
 
 		 200 aa  278  3e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  36.7 
 
 		 219 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  35.91 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 193 aa  109  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 192 aa  104  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2203  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0627793  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  35.33 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 196 aa  101  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 212 aa  99.4  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1797  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 199 aa  99.4  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0497705  normal  0.0268872 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 186 aa  99  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2475  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 197 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000212819  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 196 aa  97.1  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 213 aa  96.3  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 194 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 193 aa  95.1  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  33.69 
 
 		 194 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  31.61 
 
 		 209 aa  94  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 202 aa  92.4  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2361  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 199 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1991  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 199 aa  92  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000115862  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1726  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 199 aa  92  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.716564  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1737  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 199 aa  92  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.151738  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1549  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 199 aa  92  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1534  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 199 aa  92  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.239413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1841  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 199 aa  92  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.170954  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1980  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 199 aa  92  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00264568  hitchhiker  0.00106159 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 198 aa  92  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1906  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 199 aa  91.7  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1547  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 199 aa  91.7  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1607  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 199 aa  91.7  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 214 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1763  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139552  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2564  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1872  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0047199  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  34.66 
 
 		 219 aa  89.4  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 222 aa  89.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1860  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 199 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0204447  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 209 aa  89.4  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 200 aa  88.6  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 227 aa  87.8  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 219 aa  87.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  29.03 
 
 		 222 aa  86.7  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 206 aa  86.3  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  28.88 
 
 		 198 aa  85.9  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 210 aa  85.5  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4476  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 220 aa  85.5  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182515 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 190 aa  85.1  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 196 aa  84.7  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146337 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0162  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 201 aa  84.7  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  30.06 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  26.77 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3993  transcriptional regulator, TetR family protein  29.26 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000102791  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1702  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1388  regulatory protein, TetR  26.67 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2969  hypothetical protein  34.9 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448916  n/a   
 
 
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NC_008835  BMA10229_0121  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A0974  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.543907  n/a   
 
 
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NC_006349  BMAA1408  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal  1 
 
 
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NC_009079  BMA10247_A1493  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008784  BMASAVP1_0527  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.474473  n/a   
 
 
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NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
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NC_008577  Shewana3_0262  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000117006 
 
 
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NC_009075  BURPS668_A1058  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 190 aa  77.8  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011663  Sbal223_0268  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A2293  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.887651  n/a   
 
 
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NC_009052  Sbal_0272  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
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NC_009665  Shew185_0264  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009997  Sbal195_0272  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009438  Sputcn32_0378  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
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