More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0480 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 205 aa  423  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 193 aa  154  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 198 aa  154  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 206 aa  144  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 212 aa  141  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  40.11 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 202 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 212 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 211 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 212 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 212 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 212 aa  135  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  37.11 
 
 		 198 aa  134  7.000000000000001e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 190 aa  132  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 186 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 210 aa  130  9e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  36.04 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4097  transcriptional regulator, TetR family  37.17 
 
 		 194 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  34.22 
 
 		 196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  37.5 
 
 		 219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  34.5 
 
 		 222 aa  123  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 210 aa  122  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4476  TetR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 220 aa  122  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182515 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 202 aa  122  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 214 aa  122  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  36.26 
 
 		 209 aa  118  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  37.02 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  39.75 
 
 		 176 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 227 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 179 aa  107  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 193 aa  105  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2969  hypothetical protein  39.58 
 
 		 162 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448916  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4749  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4102  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4681  transcriptional regulator  31.69 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  33.33 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 190 aa  101  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 212 aa  101  9e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53410  transcriptional regulator  31.15 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.733487  normal  0.037637 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 212 aa  99.4  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 191 aa  98.6  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 194 aa  97.1  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3993  transcriptional regulator, TetR family protein  32.95 
 
 		 194 aa  94.7  8e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000102791  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0971  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 200 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1097  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 196 aa  94.7  9e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 199 aa  93.6  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1388  regulatory protein, TetR  30.39 
 
 		 196 aa  92.8  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5102  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 203 aa  89.7  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2203  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 206 aa  88.6  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0627793  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2475  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 197 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000212819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 221 aa  88.2  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0162  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 201 aa  87.8  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  31.38 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 194 aa  87  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  30.95 
 
 		 195 aa  86.7  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  30.68 
 
 		 199 aa  86.3  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 196 aa  86.3  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1872  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 199 aa  85.5  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0047199  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1763  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 199 aa  85.5  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139552  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2564  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 199 aa  85.5  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186036  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4468  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 198 aa  84.7  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1737  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.151738  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1534  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.239413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0272  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0264  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1906  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1607  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1797  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0497705  normal  0.0268872 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A1547  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58457  normal  1 
 
 
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NC_011663  Sbal223_0268  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009052  Sbal_0272  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  32.04 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
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NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  30.1 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
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NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146337 
 
 
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NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008577  Shewana3_0262  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000117006 
 
 
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NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
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NC_007650  BTH_II1702  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 311 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
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NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
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NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_1549  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal  1 
 
 
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CP001637  EcDH1_1991  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000115862  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_1980  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00264568  hitchhiker  0.00106159 
 
 
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NC_010658  SbBS512_E1841  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.170954  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A1726  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.716564  n/a   
 
 
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