More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4097 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4097  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 194 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  51.28 
 
 		 202 aa  194  8.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  38.02 
 
 		 198 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  37.17 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 206 aa  124  6e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 193 aa  124  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 196 aa  121  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 215 aa  121  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 196 aa  118  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 211 aa  101  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 212 aa  99.8  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 212 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 212 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 212 aa  98.2  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 186 aa  98.2  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 190 aa  97.8  8e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 212 aa  97.8  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 186 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  31.64 
 
 		 209 aa  95.9  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  30.46 
 
 		 219 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 191 aa  94.4  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 202 aa  92.8  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 210 aa  90.5  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  32.78 
 
 		 222 aa  89.7  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0971  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 200 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 210 aa  88.6  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  25.91 
 
 		 198 aa  87.8  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 192 aa  86.3  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 179 aa  84.3  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4476  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182515 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 205 aa  77.8  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  31.79 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4681  transcriptional regulator  29.14 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0121  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1493  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1408  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0527  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.474473  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A0974  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.543907  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A1058  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2293  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.887651  n/a   
 
 
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NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  30.36 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_2969  hypothetical protein  30.71 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448916  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  32.3 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53410  transcriptional regulator  28 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.733487  normal  0.037637 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 197 aa  72  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4102  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1702  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1872  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0047199  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1763  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139552  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2564  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4749  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 207 aa  67.8  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5096  transcriptional regulator, TetR family  22.81 
 
 		 197 aa  67.8  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841888  normal  0.375957 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 201 aa  67.8  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 201 aa  67.8  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1453  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 183 aa  67  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  31.65 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1097  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  27.6 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1388  regulatory protein, TetR  27.75 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2361  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_2203  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0627793  hitchhiker  0.000036044 
 
 
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NC_008048  Sala_0020  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.390674  normal  0.0209926 
 
 
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CP001637  EcDH1_1991  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000115862  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E1841  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.170954  n/a   
 
 
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NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  27.98 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A1726  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.716564  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_1549  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal  1 
 
 
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NC_010468  EcolC_1980  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00264568  hitchhiker  0.00106159 
 
 
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NC_011663  Sbal223_0268  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 193 aa  62  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  27.75 
 
 		 209 aa  62  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
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