More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0770 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 196 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  87.18 
 
 		 196 aa  355  2.9999999999999997e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  77.95 
 
 		 215 aa  318  1.9999999999999998e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  67.88 
 
 		 193 aa  273  9e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  52.85 
 
 		 193 aa  216  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  52.33 
 
 		 198 aa  215  4e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  44.81 
 
 		 219 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 212 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 212 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 212 aa  169  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 212 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  43.92 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 186 aa  164  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 210 aa  162  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  41.05 
 
 		 214 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  41.58 
 
 		 204 aa  161  6e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  42.19 
 
 		 222 aa  161  7e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  43.09 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  42.13 
 
 		 179 aa  159  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  41.44 
 
 		 209 aa  152  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 210 aa  151  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 213 aa  150  8.999999999999999e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 214 aa  149  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4476  TetR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 220 aa  149  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182515 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  39.04 
 
 		 205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 209 aa  145  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  39.15 
 
 		 192 aa  142  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  38.25 
 
 		 219 aa  135  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 219 aa  134  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2969  hypothetical protein  43.75 
 
 		 162 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448916  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 202 aa  127  9.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4749  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 207 aa  125  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 227 aa  123  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 202 aa  122  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 196 aa  116  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4097  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4102  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 190 aa  105  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 176 aa  104  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0378  TetR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 202 aa  103  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 197 aa  104  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0272  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0264  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0272  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0268  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 193 aa  102  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  33.33 
 
 		 209 aa  101  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0971  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 200 aa  101  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  35.12 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 212 aa  99.8  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 194 aa  99.4  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 209 aa  99.4  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4681  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 196 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 199 aa  98.2  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53410  transcriptional regulator  30.48 
 
 		 196 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.733487  normal  0.037637 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0262  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 198 aa  95.5  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000117006 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2564  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 199 aa  95.1  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1872  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 199 aa  95.1  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0047199  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1763  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 199 aa  95.1  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139552  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 200 aa  95.1  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 205 aa  94.7  7e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 212 aa  94  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  32.02 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2203  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0627793  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1797  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 199 aa  93.2  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0497705  normal  0.0268872 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4468  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 198 aa  92.4  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 194 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1388  regulatory protein, TetR  31.07 
 
 		 196 aa  92.4  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 206 aa  91.7  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0287  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 200 aa  91.3  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000147212 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0261  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 198 aa  90.9  9e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00036521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3760  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 198 aa  90.9  9e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  37.19 
 
 		 195 aa  91.3  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  30.05 
 
 		 194 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 211 aa  90.5  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0162  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 201 aa  90.5  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1991  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 199 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000115862  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1841  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 199 aa  89.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.170954  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1980  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 199 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00264568  hitchhiker  0.00106159 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1726  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 199 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.716564  n/a   
 
 
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NC_008345  Sfri_3993  transcriptional regulator, TetR family protein  29.94 
 
 		 194 aa  89.7  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000102791  n/a   
 
 
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NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 196 aa  89.4  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146337 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 206 aa  88.6  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_1860  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 199 aa  88.6  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0204447  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_2361  transcriptional regulator, TetR family  32.07 
 
 		 199 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal  1 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_1549  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 199 aa  88.2  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal  1 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 206 aa  87.8  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
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NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 206 aa  87.8  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 206 aa  87.8  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
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NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 196 aa  87.8  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
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NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 206 aa  87.8  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007908  Rfer_0016  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 206 aa  87.8  9e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.951687  n/a   
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_1097  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 196 aa  87.8  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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