More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2547 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 196 aa  403  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4138  transcriptional regulator, TetR family  51.79 
 
 		 203 aa  202  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 204 aa  124  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 204 aa  122  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0482  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 213 aa  122  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 		 205 aa  121  7e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0541  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 220 aa  103  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1410  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 194 aa  96.3  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 196 aa  91.7  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 196 aa  87.8  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 215 aa  84.3  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  24.48 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 212 aa  77.8  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  28.48 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C37  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  22.8 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 212 aa  72  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
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NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
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NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  26.9 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  23.6 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4537  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340013  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
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NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
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NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  26 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5004  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0270987  normal  0.0251839 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  25 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0888  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3574  TetR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  21.3 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5102  TetR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  23.53 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  20.92 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  20.94 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0020  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.390674  normal  0.0209926 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 223 aa  62  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  20.35 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  21.6 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  21.97 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  23.33 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53410  transcriptional regulator  25 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.733487  normal  0.037637 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3816  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0181155  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  24.42 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0985  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  22.52 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1893  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0175452  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  22.09 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0055  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.727514  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4681  transcriptional regulator  24.1 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1013  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_1228  TetR family transcriptional regulator  21.51 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
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NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
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NC_011145  AnaeK_3199  transcriptional regulator, TetR family  22.64 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0468642  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_3294  transcriptional regulator, TetR family  22.64 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_0503  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004347  SO_3393  TetR family transcriptional regulator  20.93 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_3208  TetR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000777782  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A0503  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  21.81 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
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NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  22.54 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
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NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
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NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
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NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  1 
 
 
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