More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2644 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 205 aa  426  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  41.34 
 
 		 189 aa  143  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7959  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 194 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 197 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
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NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  40.33 
 
 		 196 aa  137  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_2047  transcriptional regulator, TetR family  37.85 
 
 		 188 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.199455 
 
 
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NC_008009  Acid345_3574  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 187 aa  123  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
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NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
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NC_008505  LACR_C37  transcriptional regulator  29.82 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  27.49 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  27.47 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  25.26 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  26.99 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
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NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
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NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  27.78 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
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NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  30.66 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002947  PP_4295  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
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NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
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NC_010322  PputGB1_3860  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.526451  normal  0.667209 
 
 
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NC_010501  PputW619_3620  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_1574  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00597987  normal  1 
 
 
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NC_014158  Tpau_1170  transcriptional regulator, TetR family  48.53 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
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NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_1799  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.539023  normal  0.822653 
 
 
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NC_013517  Sterm_1582  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000313158  n/a   
 
 
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NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
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NC_013515  Smon_0469  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_012792  Vapar_6204  transcriptional regulator, TetR family  26.59 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308886  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1833  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3641  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3212  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
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NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
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NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
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NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  47.69 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
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NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  47.69 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
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NC_007530  GBAA_0955  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_0539  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B2044  transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.505226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011138  MADE_02513  transcriptional regulator, TetR family protein  39.78 
 
 		 214 aa  62  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2926  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 188 aa  62  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529467  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  42.17 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
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NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 206 aa  62  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 206 aa  62  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
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NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
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NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
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NC_008782  Ajs_2441  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.509096 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3228  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00722998  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_2970  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A3236  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0469246  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0303  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402109  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
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NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_5550  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0856  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.257581  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0971  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
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NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A3194  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0195  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.5282  normal  0.427112 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
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NC_009439  Pmen_2767  TetR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0855812  normal  0.684751 
 
 
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NC_007794  Saro_0973  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269206  n/a   
 
 
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NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
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NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  40.22 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
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NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  25.65 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
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NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
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NC_009511  Swit_3569  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  1 
 
 
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NC_013521  Sked_34730  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  1 
 
 
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NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013132  Cpin_6698  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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