More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4218 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3493  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729173  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 190 aa  62  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4041  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  normal  0.0505107 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 291 aa  61.6  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 183 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4322  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 408 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5380  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768843  normal  0.61228 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 770 aa  58.2  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2134  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  32.95 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3360  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.372466  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  34.44 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0653  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  35.06 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2639  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  24.2 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1417  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22703  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0891  transcriptional regulator BetI  25.56 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  25.88 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  23.03 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2902  regulatory protein, TetR  24.39 
 
 		 253 aa  54.7  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.271799  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  28.15 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 238 aa  54.3  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1884  TetR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.543413  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  22.73 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2270  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  35.82 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 275 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1965  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 273 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 273 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 273 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  29.13 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 272 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>