More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1254 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  441  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4572  putative transcriptional regulator, TetR family  52.09 
 
 		 223 aa  191  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145324  normal  0.111989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  46.82 
 
 		 220 aa  188  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  41.12 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1037  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 271 aa  94  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1167  regulatory protein, TetR  35.02 
 
 		 227 aa  92.8  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  37.32 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  29.49 
 
 		 343 aa  79.3  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 218 aa  78.2  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2589  regulatory protein TetR  40.5 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4362  regulatory protein, TetR  29 
 
 		 256 aa  75.1  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3091  TetR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  28.31 
 
 		 247 aa  72  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  28.97 
 
 		 222 aa  72  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2792  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 190 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.782155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 216 aa  72  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 249 aa  71.6  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  28.91 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6418  transcriptional regulator, TetR family  26.61 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  29.72 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3625  TetR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 246 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 183 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1017  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.056125 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 343 aa  65.5  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0744  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0222814 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  26.82 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  29.86 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  31.43 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4012  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00441742  normal  0.139253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  41.57 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2879  regulatory protein TetR  30.62 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2719  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2840  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  33.56 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  26.57 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2728  putative transcriptional regulator, TetR family  45.95 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  28.12 
 
 		 311 aa  62  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4132  transcriptional regulator, TetR family  27.83 
 
 		 192 aa  62  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0628  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 218 aa  62  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.504351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 232 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  28.51 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24780  transcriptional regulator, tetR family  26.39 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2976  regulatory protein TetR  41.28 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  26.99 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  46.05 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3070  transcriptional regulator, TetR family  43.9 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  37.89 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3085  regulatory protein, TetR  34.38 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.355286  normal  0.26404 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1574  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 278 aa  58.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  28.82 
 
 		 293 aa  58.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 244 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  27.83 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  29.6 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  28 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  31.7 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  38.3 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  36.29 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>