More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2572 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 239 aa  474  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4056  transcriptional regulator, TetR family  51.83 
 
 		 209 aa  176  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.910923  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  39.42 
 
 		 210 aa  125  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 244 aa  98.6  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  39.07 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 244 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 244 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 230 aa  89.4  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  36.91 
 
 		 218 aa  85.1  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 285 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  37.24 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  35.12 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 211 aa  81.6  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  36.75 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1167  regulatory protein, TetR  41.01 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1037  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  38.79 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  44.79 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  36.43 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3085  regulatory protein, TetR  28.7 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.355286  normal  0.26404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1495  TetR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.969103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 272 aa  68.6  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 221 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  32.19 
 
 		 213 aa  67  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1404  hypothetical protein  29.48 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.245587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6418  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 		 249 aa  65.1  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3395  transcriptional regulator, TetR family  41.84 
 
 		 173 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  41.84 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  31.21 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  31.21 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3625  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  31.21 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  41.57 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  28.23 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10210  transcriptional regulator  25.45 
 
 		 272 aa  62  0.000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.472309  normal  0.0650558 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0832  Tetracyclin repressor domain protein  33.55 
 
 		 204 aa  61.6  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1702  regulatory protein TetR  37.34 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3091  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26640  transcriptional regulator, tetR family  34.78 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.062936  normal  0.0737104 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1017  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.056125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0628  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.504351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  36.29 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  34.82 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3670  hypothetical protein  27.73 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4012  TetR family transcriptional regulator  39 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00441742  normal  0.139253 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3471  hypothetical protein  27.73 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3344  hypothetical protein  27.73 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  44.74 
 
 		 315 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  28.22 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>