199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2420 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  100 
 
 		 190 aa  371  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4012  TetR family transcriptional regulator  63.92 
 
 		 195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00441742  normal  0.139253 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1702  regulatory protein TetR  45.95 
 
 		 199 aa  124  7e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1404  hypothetical protein  39.73 
 
 		 227 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.245587  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2574  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0758263 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  43.54 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 		 228 aa  85.9  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  36.75 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  31.8 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  31.48 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 259 aa  74.3  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  38.06 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  33.69 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  34.75 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  34.73 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  42.06 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 211 aa  67  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1017  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.056125 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0832  Tetracyclin repressor domain protein  33.55 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2728  putative transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 244 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 221 aa  61.2  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 231 aa  61.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  33.95 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  32.19 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3395  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0683  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0129651  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  25.84 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1495  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.969103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0039  transcriptional regulator  28.93 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3334  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  42.7 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1167  regulatory protein, TetR  33.74 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  32.39 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  36.44 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 249 aa  55.1  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 223 aa  54.7  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  25.97 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3140  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 250 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3202  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 250 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3152  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 250 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.840022 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 304 aa  53.9  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 238 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1037  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 238 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 283 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  36.04 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>