More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2337 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 218 aa  427  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  55.98 
 
 		 250 aa  221  9e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  52.36 
 
 		 211 aa  206  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  50.25 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0837  transcriptional regulator, TetR family  39.9 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.895795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  40.65 
 
 		 218 aa  92.8  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 245 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0039  transcriptional regulator  34.13 
 
 		 233 aa  90.9  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0683  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 243 aa  90.1  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0129651  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  35.81 
 
 		 223 aa  90.1  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 271 aa  89.4  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 224 aa  89.4  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  35.91 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 239 aa  85.9  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 218 aa  85.5  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1017  TetR family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 216 aa  85.1  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.056125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 		 249 aa  85.1  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  39.64 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  44.36 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  36.74 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  33.62 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  31.42 
 
 		 268 aa  82  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1632  Tetracyclin repressor domain protein  33.82 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0188717 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0832  Tetracyclin repressor domain protein  38.06 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  36.18 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  37.24 
 
 		 258 aa  78.6  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  38.26 
 
 		 239 aa  78.2  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  35.33 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0039  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 202 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  35.03 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 285 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1404  hypothetical protein  29.95 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.245587  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10310  transcriptional regulator, tetR family  40 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  33.49 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  33.49 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  33.49 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0251  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  34.63 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  33.95 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 229 aa  72  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 223 aa  72  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 235 aa  72  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 242 aa  71.6  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  36.03 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2177  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.191251  normal  0.46056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8685  Tetracyclin repressor domain protein  35.75 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  33.19 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 304 aa  68.6  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 244 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 242 aa  67  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  38.39 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  36.43 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2879  regulatory protein TetR  33.85 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  32.6 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  37.98 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  34.38 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  30.45 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>