165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1404 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1404  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.245587  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2574  transcriptional regulator, TetR family  49.77 
 
 		 203 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0758263 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  39.73 
 
 		 190 aa  119  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1702  regulatory protein TetR  39.34 
 
 		 199 aa  101  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4012  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 195 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00441742  normal  0.139253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  28.95 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  29.82 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  29.18 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 259 aa  68.6  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 233 aa  68.2  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 236 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2719  transcriptional regulator, TetR family  24.89 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1017  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.056125 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  32.1 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0832  Tetracyclin repressor domain protein  30.86 
 
 		 204 aa  62  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2728  putative transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  33.58 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0039  transcriptional regulator  27.75 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0039  transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3348  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 246 aa  58.5  0.00000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  27.31 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 214 aa  57  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7060  tetracycline repressor domain-containing protein  29.91 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0598818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3750  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  23.77 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2719  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0628  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.504351 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 245 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0181  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0664  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.783759  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 238 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0837  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 238 aa  53.1  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.895795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0631  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 220 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 221 aa  53.1  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 268 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 253 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 258 aa  52  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4056  transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 209 aa  52  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.910923  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 213 aa  52.4  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  28.45 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  25.61 
 
 		 343 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  24.55 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  27.9 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  26.82 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 		 249 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 192 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 192 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3091  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 192 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 283 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 221 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0559  TetR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3395  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 173 aa  49.7  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0585  TetR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  0.581317 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>