243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5957 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
229 aa  463  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  49.32 
 
 
234 aa  215  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  36.86 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 
249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  36.16 
 
 
239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 
268 aa  124  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  37.34 
 
 
238 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  37.89 
 
 
247 aa  121  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  34.78 
 
 
248 aa  116  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  36.09 
 
 
253 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 
263 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  36.74 
 
 
293 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 
283 aa  115  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  37.78 
 
 
315 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  36.17 
 
 
256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4763  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000323039  decreased coverage  0.0000700922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  36.6 
 
 
248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 
241 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
255 aa  112  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  34.6 
 
 
268 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2430  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6279  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 
235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4362  regulatory protein, TetR  33.61 
 
 
256 aa  108  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 
259 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 
272 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  34.85 
 
 
262 aa  105  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 
304 aa  104  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  32.55 
 
 
311 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 
250 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  33.74 
 
 
267 aa  102  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  33.62 
 
 
247 aa  101  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  32.92 
 
 
343 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 
248 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 
272 aa  99.8  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 
242 aa  99  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  34.91 
 
 
342 aa  98.6  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  33.19 
 
 
272 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0056  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 
289 aa  97.1  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5853  transcriptional regulator, TetR family  34.8 
 
 
258 aa  95.9  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.389129  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 
233 aa  95.5  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5933  regulatory protein TetR  35.71 
 
 
250 aa  95.9  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  32.51 
 
 
266 aa  95.9  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1527  transcriptional regulator, TetR family  40.48 
 
 
263 aa  95.5  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  32.62 
 
 
247 aa  95.1  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
255 aa  94.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  33.19 
 
 
226 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  35.81 
 
 
249 aa  93.2  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  33.06 
 
 
264 aa  92.4  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 
281 aa  91.7  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
257 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  30.77 
 
 
266 aa  90.1  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 
229 aa  88.2  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  33.19 
 
 
223 aa  88.2  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 
234 aa  88.2  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 
231 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
239 aa  87  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  33.05 
 
 
230 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0092  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
330 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0672  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 
257 aa  87.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  32.13 
 
 
265 aa  86.7  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 
218 aa  85.1  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
315 aa  85.5  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 
268 aa  85.1  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 
252 aa  84.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 
224 aa  83.6  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4078  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
269 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152777  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2560  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
272 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.283011  normal  0.208167 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
250 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  40.87 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 
249 aa  82  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 
221 aa  80.1  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  30.24 
 
 
223 aa  80.1  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4188  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 
256 aa  79  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  30.91 
 
 
343 aa  79  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  33.82 
 
 
239 aa  78.2  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1468  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  30.04 
 
 
245 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8685  Tetracyclin repressor domain protein  32.89 
 
 
228 aa  76.3  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1574  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 
258 aa  76.3  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 
228 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 
240 aa  74.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 
218 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  31.08 
 
 
226 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 
278 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4456  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3445  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2453  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 
223 aa  72  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106386  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
235 aa  71.6  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 
263 aa  71.6  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1632  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275496  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  29.96 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  27.1 
 
 
222 aa  70.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2193  regulatory protein TetR  34.27 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00970434  hitchhiker  0.00792169 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  29.96 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0353896 
 
 
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NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
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NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  32.76 
 
 
227 aa  68.9  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
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