248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4066 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 253 aa  510  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  58.58 
 
 		 283 aa  290  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  54.4 
 
 		 259 aa  256  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  52.82 
 
 		 248 aa  228  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  48.39 
 
 		 262 aa  225  5.0000000000000005e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4078  TetR family transcriptional regulator  49.41 
 
 		 269 aa  217  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  47.45 
 
 		 265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2560  TetR family transcriptional regulator  47.6 
 
 		 272 aa  215  5e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.283011  normal  0.208167 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 248 aa  206  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  46.12 
 
 		 255 aa  205  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  45.02 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  46.31 
 
 		 272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  43.3 
 
 		 263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  41.7 
 
 		 315 aa  165  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  39.3 
 
 		 249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  39.84 
 
 		 342 aa  161  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  39.17 
 
 		 304 aa  155  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4456  transcriptional regulator, TetR family  42.57 
 
 		 258 aa  152  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0092  GntR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 330 aa  143  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  35.22 
 
 		 268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 267 aa  138  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  36.89 
 
 		 239 aa  138  8.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 266 aa  128  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1632  transcriptional regulator, TetR family  44.87 
 
 		 310 aa  123  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275496  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  37.22 
 
 		 293 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 239 aa  122  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2430  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  35.17 
 
 		 234 aa  116  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  36.09 
 
 		 229 aa  116  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  34.08 
 
 		 343 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 		 311 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  31.28 
 
 		 247 aa  112  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 230 aa  111  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1574  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  33.74 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4362  regulatory protein, TetR  32.03 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3140  TetR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 250 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3202  TetR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 250 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3152  TetR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 250 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.840022 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 252 aa  106  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  34.71 
 
 		 256 aa  105  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4763  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000323039  decreased coverage  0.0000700922 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 343 aa  102  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 255 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 229 aa  99.4  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6279  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 235 aa  99  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  35.1 
 
 		 247 aa  98.6  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5853  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 258 aa  98.2  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.389129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 255 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8685  Tetracyclin repressor domain protein  44 
 
 		 228 aa  95.5  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 218 aa  94  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4188  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 		 249 aa  93.2  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 272 aa  92.4  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2193  regulatory protein TetR  31.25 
 
 		 243 aa  92.4  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00970434  hitchhiker  0.00792169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1468  transcriptional regulator, TetR family  32.51 
 
 		 283 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3445  transcriptional regulator, TetR family  40.13 
 
 		 230 aa  91.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 250 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1527  transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 315 aa  90.5  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 242 aa  89.4  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  37.41 
 
 		 233 aa  86.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  32.44 
 
 		 249 aa  85.9  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  31.95 
 
 		 266 aa  85.5  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 271 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 241 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0672  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  38.52 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  35.81 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  25 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  26.05 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  35.46 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0056  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5781  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 264 aa  75.1  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  28.51 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 235 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26640  transcriptional regulator, tetR family  37.93 
 
 		 215 aa  71.6  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.062936  normal  0.0737104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 228 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>