229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4781 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 228 aa  461  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  59.56 
 
 		 234 aa  281  5.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  55.95 
 
 		 226 aa  235  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  39.82 
 
 		 249 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 268 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 		 272 aa  112  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 271 aa  97.8  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  29.18 
 
 		 272 aa  96.7  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 248 aa  91.7  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 249 aa  89.4  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  34.4 
 
 		 218 aa  88.6  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 245 aa  86.3  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 		 223 aa  85.1  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  30.64 
 
 		 343 aa  78.6  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  30.9 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 250 aa  75.1  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  24.8 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 226 aa  72  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  26.87 
 
 		 239 aa  72  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2193  regulatory protein TetR  30.53 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00970434  hitchhiker  0.00792169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  38.52 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2430  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  30.04 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  28.45 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  26.72 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 266 aa  68.6  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  27.83 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  27.56 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  25.33 
 
 		 247 aa  68.2  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0744  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0222814 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2560  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.283011  normal  0.208167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  25.78 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 283 aa  65.1  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1989  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 250 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  25.51 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  26.25 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6279  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0056  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  25.65 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 231 aa  62  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 214 aa  62  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  27.48 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  27.48 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  27.48 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  27.64 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5933  regulatory protein TetR  32.14 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  36.15 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2879  regulatory protein TetR  41.58 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11383  transcriptional regulator  24.89 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.900966 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  24.77 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  25.58 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2840  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4078  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4355  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  23.96 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 255 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  23.42 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  26.64 
 
 		 342 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0837  transcriptional regulator, TetR family  33.56 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.895795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0414  transcriptional regulator, TetR family  22.52 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>