266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3462 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  100 
 
 		 221 aa  429  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2879  regulatory protein TetR  54.95 
 
 		 226 aa  218  6e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0744  TetR family transcriptional regulator  53.77 
 
 		 224 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0222814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6384  putative transcriptional regulator, TetR family  50.7 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.317451  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2840  transcriptional regulator, TetR family  47.2 
 
 		 238 aa  189  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3340  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2494  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 257 aa  125  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000125237  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 271 aa  75.1  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  38.52 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  30.66 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  39.36 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26640  transcriptional regulator, tetR family  32.52 
 
 		 215 aa  62  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.062936  normal  0.0737104 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1602  transcriptional regulator  25.87 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  33.97 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  25.44 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  27.52 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6339  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  41.56 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0135  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1495  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.969103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1952  regulatory protein TetR  32.24 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19920  transcriptional regulator, tetR family  30.82 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314765  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3109  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0137482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  24.76 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5079  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  25.57 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  42.55 
 
 		 343 aa  55.1  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 229 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  41.58 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 304 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0983  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 244 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1001  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 244 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 268 aa  53.9  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1011  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0837  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.895795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  31.15 
 
 		 293 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 239 aa  53.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 235 aa  53.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  32.45 
 
 		 262 aa  53.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 283 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  27.35 
 
 		 222 aa  53.1  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 343 aa  52.4  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0039  transcriptional regulator  25.58 
 
 		 233 aa  52  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1278  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 191 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.885926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3560  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 247 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.499755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 221 aa  51.6  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 255 aa  52  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  30.49 
 
 		 190 aa  51.6  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0287  hypothetical protein  39.47 
 
 		 150 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.889476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19280  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.28299  normal  0.286722 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4763  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 252 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000323039  decreased coverage  0.0000700922 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  27.63 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 258 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  50.82 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3091  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4679  regulatory protein TetR  34.04 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  25.84 
 
 		 249 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>