149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3340 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3340  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 227 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2494  transcriptional regulator, TetR family  64.25 
 
 		 257 aa  273  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000125237  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  38.25 
 
 		 221 aa  144  8.000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6384  putative transcriptional regulator, TetR family  42.79 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.317451  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2879  regulatory protein TetR  41.28 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0744  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0222814 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2840  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 		 238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 253 aa  65.1  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  28.57 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  31.54 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  26.82 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  29.86 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  27.19 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6339  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1989  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 285 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26640  transcriptional regulator, tetR family  31.61 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.062936  normal  0.0737104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0837  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.895795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 249 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  26.2 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3445  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 230 aa  53.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19920  transcriptional regulator, tetR family  30.2 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314765  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 248 aa  52.8  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  30.2 
 
 		 266 aa  52  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  30.84 
 
 		 228 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 221 aa  52  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 315 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 304 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1602  transcriptional regulator  26.28 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 263 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 278 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 343 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4056  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.910923  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0251  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 259 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11383  transcriptional regulator  25.56 
 
 		 261 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.900966 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  26.8 
 
 		 311 aa  48.9  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  26.03 
 
 		 265 aa  48.9  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4355  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 244 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  25.85 
 
 		 256 aa  48.9  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 234 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  23.87 
 
 		 228 aa  48.5  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 213 aa  48.5  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0039  transcriptional regulator  26.47 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 283 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1632  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 310 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275496  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2728  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0632  transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.639401  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1770  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1817  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1751  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0039  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2430  transcriptional regulator, TetR family  37.62 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  23.38 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>