224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4355 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4355  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 244 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1989  TetR family transcriptional regulator  91.8 
 
 		 250 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1770  TetR family transcriptional regulator  69.26 
 
 		 250 aa  358  4e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1817  TetR family transcriptional regulator  69.26 
 
 		 250 aa  358  4e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1751  TetR family transcriptional regulator  69.26 
 
 		 250 aa  358  4e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11383  transcriptional regulator  70.87 
 
 		 261 aa  347  1e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.900966 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3861  regulatory protein TetR  39.29 
 
 		 231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2594  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 221 aa  98.6  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.971437  normal  0.0759549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  29.63 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  29.63 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  29.63 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 211 aa  72  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  25.63 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  24.66 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  25.1 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  26.07 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  24.02 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2728  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  28.63 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1495  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.969103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1040  regulatory protein TetR  27.33 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.591621  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3273  Tetracyclin repressor domain protein  25.23 
 
 		 213 aa  61.6  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120229  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  24.09 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  29.01 
 
 		 343 aa  58.9  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0092  GntR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 330 aa  58.9  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 210 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4763  transcriptional regulator, TetR family  23.65 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000323039  decreased coverage  0.0000700922 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  23.95 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4056  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.910923  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7060  tetracycline repressor domain-containing protein  26.73 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0598818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  27.83 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  26.36 
 
 		 222 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  24.78 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  28.63 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  24.2 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  25.82 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  25.78 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  25.32 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  30.21 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  33.33 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  23.75 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3105  TetR family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3085  regulatory protein, TetR  29.5 
 
 		 223 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.355286  normal  0.26404 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3366  regulatory protein, TetR  27.16 
 
 		 221 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.402677  normal  0.315376 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  30.4 
 
 		 221 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  56.25 
 
 		 185 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5480  TetR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 199 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  24.09 
 
 		 252 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  22.58 
 
 		 234 aa  53.1  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 235 aa  53.1  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 257 aa  53.1  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 223 aa  52.8  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 271 aa  52.8  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  26.48 
 
 		 218 aa  52.8  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  25.94 
 
 		 315 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 249 aa  52.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 223 aa  52.4  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 253 aa  52.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  25.45 
 
 		 247 aa  52  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0594  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 208 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>