More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0632 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0632  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 226 aa  459  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.639401  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6339  transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19280  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.28299  normal  0.286722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5353  putative transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.565749  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3560  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.499755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4679  regulatory protein TetR  30.81 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0135  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  28.45 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  38.24 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2840  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1167  regulatory protein, TetR  39.05 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  30.99 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1037  TetR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  27.8 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  37.17 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  39.33 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0040  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2430  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 252 aa  62  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 242 aa  62  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  46.27 
 
 		 256 aa  62  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 272 aa  62  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 230 aa  61.6  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3091  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  38.83 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0672  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  34.82 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  36.84 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6384  putative transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.317451  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2879  regulatory protein TetR  34.02 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5933  regulatory protein TetR  38.96 
 
 		 250 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  31.97 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  39 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  33.03 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  42.67 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4572  putative transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145324  normal  0.111989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1527  transcriptional regulator, TetR family  34.73 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0056  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 289 aa  55.5  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  28.04 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8685  Tetracyclin repressor domain protein  35.51 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  25.81 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04290  transcriptional regulator  44.83 
 
 		 230 aa  54.3  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0356089  normal  0.115644 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3625  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 190 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4763  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 252 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000323039  decreased coverage  0.0000700922 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1495  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 200 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.969103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3140  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3202  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 391 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2453  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106386  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  23.35 
 
 		 311 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3152  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.840022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 262 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  35.53 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0040  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.970085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3348  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 185 aa  53.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 343 aa  53.5  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>