179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0251 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0251  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1632  Tetracyclin repressor domain protein  40.59 
 
 		 207 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0188717 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0832  Tetracyclin repressor domain protein  38.73 
 
 		 204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0039  transcriptional regulator  31.86 
 
 		 233 aa  105  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0039  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 202 aa  102  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0837  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 238 aa  100  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.895795  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0683  transcriptional regulator, TetR family  30.45 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0129651  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  32.8 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 221 aa  71.2  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 285 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  28.37 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10310  transcriptional regulator, tetR family  29.93 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  27.7 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3270  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8331  normal  0.0947304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 255 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  25.24 
 
 		 224 aa  64.7  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  26.76 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6418  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  29.86 
 
 		 240 aa  62  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26640  transcriptional regulator, tetR family  32.67 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.062936  normal  0.0737104 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  24.68 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  29.77 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0414  transcriptional regulator, TetR family  23.36 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3670  hypothetical protein  30.88 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3471  hypothetical protein  30.88 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  24.02 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  30.62 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  21.3 
 
 		 246 aa  57  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  27.52 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3395  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3340  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  28.17 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3344  hypothetical protein  30.15 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  25.35 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  24.1 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 235 aa  54.7  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 236 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 238 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4446  hypothetical protein  30.08 
 
 		 229 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.25718 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  23.76 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 250 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1491  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.784951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  25.24 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 248 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  25.57 
 
 		 263 aa  52.8  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  25.35 
 
 		 247 aa  52.4  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 281 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 232 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3085  regulatory protein, TetR  27.62 
 
 		 223 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.355286  normal  0.26404 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  29.7 
 
 		 225 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 315 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  29.7 
 
 		 225 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  29.7 
 
 		 225 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 239 aa  51.6  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  23.39 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  27.97 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4960  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0493125  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  22.59 
 
 		 264 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6425  putative transcriptional regulator, TetR family  27.48 
 
 		 247 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857124 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 265 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11383  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 261 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.900966 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1952  regulatory protein TetR  28.21 
 
 		 241 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04290  transcriptional regulator  25.69 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0356089  normal  0.115644 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2193  regulatory protein TetR  27.97 
 
 		 243 aa  49.7  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00970434  hitchhiker  0.00792169 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1017  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.056125 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  22.97 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10210  transcriptional regulator  24.07 
 
 		 272 aa  49.3  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.472309  normal  0.0650558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  23.96 
 
 		 245 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>